Perbedaan yang menonjol antara motif dan domain dalam struktur protein adalah motif adalah struktur super sekunder sedangkan domain protein adalah struktur protein tersier . Lebih jauh, motif melakukan fungsi biologis yang serupa melalui keluarga protein tertentu, sementara domain protein berkembang, berfungsi, dan ada secara independen dari sisa rantai protein.
Motif dan domain adalah jenis komponen struktural yang dapat terjadi dalam rantai protein. Selain itu, mereka memiliki kepentingan struktural dan fungsional dalam protein.
Topik bahasan kami tentang:
- Apa yang dimaksud dengan Motif dalam Struktur Protein – Pengertian, Struktur, Kepentingan 2. Apa yang dimaksud Domain dalam Struktur Protein – Pengertian, Struktur, Kepentingan 3. Apa Persamaan Antara Motif dan Domain dalam Struktur Protein – Garis Besar Ciri Umum 4. Apa Perbedaan Antara Motif dan Domain dalam Struktur Protein – Perbandingan Perbedaan Utama
Istilah Utama
Domain Protein, Motif Protein, Struktur Protein, Struktur Supersekunder, Struktur Tersier
Yang perlu anda ketahui tentang Motif dalam Struktur Protein?
Motif adalah struktur super sekunder dari protein. Umumnya, struktur 3D protein yang pertama berkembang adalah struktur sekunder, yang dapat berupa alfa-helix atau beta-sheet . Juga, struktur sekunder ini dibentuk untuk menetralkan polaritas alami asam amino yang berbeda dalam struktur protein primer , yang merupakan urutan asam amino. Biasanya, netralisasi ini terjadi melalui pembentukan ikatan hidrogen. Selanjutnya, struktur sekunder ini bergabung satu sama lain untuk membentuk motif-motif ini. Penggabungan terjadi melalui loop kecil.
Gambar 1: Motif Serat Seng
Selain itu, terkadang motif dari keluarga protein tertentu melakukan fungsi yang sama. Sebagai contoh, motif serat seng melakukan fungsi pengikatan DNA. Beberapa contoh motif lain dalam struktur protein adalah motif beta-hairpin, motif kunci Yunani, motif omega loop, motif helix-loop-helix, motif helix-turn-helix, motif sarang, motif niche, dll.
Yang perlu anda ketahui tentang Domain dalam Struktur Protein
Domain dalam struktur protein adalah struktur tersier protein. Selain itu, ia terbentuk, ada, dan berfungsi secara independen dari komponen protein lainnya. Meskipun suatu motif terbentuk melalui interaksi unsur struktur sekunder dalam suatu protein, interaksi yang terjadi antar unsur struktur sekunder lebih kuat dalam suatu domain. Di sini, beberapa jenis ikatan dapat terbentuk antara unsur struktural sekunder ini. Dari itu, jenis ikatan utama yang terbentuk adalah jembatan disulfida. Mereka adalah interaksi yang paling stabil juga.
Gambar 2: Tiga Domain Piruvat Kinase
Selain itu, ikatan ionik atau jembatan garam juga dapat terbentuk antara asam amino bermuatan positif dan negatif dalam struktur sekunder. Selain itu, ikatan hidrogen dapat terbentuk untuk menstabilkan struktur tersier. Di sisi lain, domain protein biasanya memiliki struktur globular, dan larut dalam air. Juga, domain protein melakukan fungsi unik dari protein. Secara umum, empat kelas domain protein dapat diidentifikasi; domain semua-α, domain semua-β, domain +β, dan domain /β.
Persamaan Antara Motif dan Domain dalam Struktur Protein
- Motif dan domain adalah dua komponen struktur protein.
- Mereka memiliki kepentingan struktural dan fungsional dalam struktur protein.
- Juga, keduanya terdiri dari rantai asam amino yang dihubungkan oleh ikatan peptida.
- Selain itu, mereka dibuat melalui interaksi alfa-heliks dan beta-sheet.
- Selain itu, keduanya adalah struktur 3D.
Perbedaan Antara Motif dan Domain dalam Struktur Protein
Definisi
Motif dalam struktur protein adalah istilah untuk struktur biologis seperti rantai yang terdiri dari konektivitas antara unsur struktural sekunder sementara domain dalam struktur protein adalah istilah untuk unit lipat independen dari struktur protein tiga dimensi. Jadi, inilah Perbedaan yang menonjol antara motif dan domain.
Jenis Struktur
Perbedaan lain antara motif dan domain adalah motif adalah struktur super sekunder protein, sedangkan domain adalah struktur tersier protein.
Pembentukan
Selain itu, motif dibentuk oleh heliks alfa dan lembaran beta yang terhubung melalui loop, sedangkan domain dibentuk oleh pembentukan jembatan disulfida, ikatan ion, dan ikatan hidrogen antara rantai samping asam amino.
Makna
Motif terutama memiliki fungsi struktural dalam struktur protein, sedangkan domain terutama memiliki kepentingan fungsional.
Fungsi
Selain itu, motif memiliki fungsi yang sama melalui keluarga protein, sedangkan domain memiliki fungsi yang unik.
Stabilitas
Selain itu, motif tidak stabil secara independen, sedangkan domain stabil secara independen. Maka dari itu, ini juga merupakan perbedaan penting antara motif dan domain.
Kata terakhir
Motif dalam struktur protein adalah struktur super sekunder dari protein. Konektivitas antara alfa-heliks dan beta-sheet menghasilkan motif. Juga, mereka memiliki fungsi serupa dalam keluarga protein tertentu. Di sisi lain, domain adalah struktur tersier protein. Secara signifikan, itu dapat terbentuk dan ada secara independen dalam struktur protein. Juga, ia memiliki fungsi unik dalam struktur protein. Maka dari itu, Perbedaan yang menonjol antara motif dan domain adalah struktur dan kepentingannya.
Sumber bacaan:
- “Struktur 3D Protein: Tingkat Struktur, Motif, dan Lipatan.” Prinsip Dasar Struktur Tiga Dimensi Protein: Tingkatan Struktur Protein, Motif, Domain dan Basis Data , Tersedia Di Sini .
Sumber gambar:
- “Zinc finger rendered” Oleh Thomas Splettstoesser (www.scistyle.com) – buatan sendiri, berdasarkan struktur PDB 1A1L, alat visualisasi molekuler open source PyMol dan Cinema 4D ( CC BY-SA 4.0 ) melalui Commons Wikimedia 2. “Domain protein kinase piruvat” Oleh Thomas Splettstoesser (www.scistyle.com) – Karya sendiri ( CC BY-SA 3.0 ) melalui Commons Wikimedia
