Perbedaan yang menonjol antara perbaikan mismatch dan perbaikan eksisi nukleotida adalah perbaikan mismatch (MMR) bertanggung jawab untuk menghilangkan ketidakcocokan basa dan loop penyisipan/penghapusan kecil yang diperkenalkan selama replikasi DNA , sedangkan perbaikan eksisi nukleotida (NER) bertanggung jawab untuk menghilangkan berbagai kerusakan DNA yang terjadi akibat radiasi ultraviolet. Selanjutnya, sel menjalani perbaikan ketidakcocokan segera setelah sintesis DNA sementara sel menjalani perbaikan eksisi nukleotida jika DNA rusak.
Perbaikan ketidakcocokan dan perbaikan eksisi nukleotida adalah dua mekanisme yang mencegah mutasi dan perubahan permanen lainnya dalam urutan DNA.
Topik bahasan kami tentang:
- Apa itu Perbaikan Ketidakcocokan – Definisi, Proses, Pentingnya 2. Apa Itu Perbaikan Eksisi Nukleotida – Definisi, Proses, Pentingnya 3. Apa Persamaan Antara Perbaikan Ketidakcocokan dan Perbaikan Eksisi Nukleotida – Garis Besar Karakteristik Umum 4. Apa Perbedaan Antara Perbaikan Ketidakcocokan dan Perbaikan Eksisi Nukleotida – Perbandingan Perbedaan Utama
Istilah Utama
Kerusakan DNA, Perbaikan DNA, Perbaikan Ketidakcocokan (MMR), Perbaikan Eksisi Nukleotida (NER), Kesalahan Replikasi
Yang perlu anda ketahui tentang Perbaikan Ketidakcocokan
Perbaikan mismatch (MMR) adalah mekanisme perbaikan DNA yang terjadi tepat setelah replikasi DNA. Maka dari itu, tujuan utama dari mekanisme ini adalah untuk menghapus dan mengganti basis yang tidak berpasangan, yang tidak diperbaiki dengan proofreading. Selain itu, ia mendeteksi dan mengoreksi penyisipan dan penghapusan kecil yang terjadi karena slip DNA polimerase.
Gambar 1: Mekanisme Perbaikan Ketidakcocokan
Biasanya, tiga protein dalam sistem perbaikan ketidakcocokan E. coli adalah MutS, MutL, dan MutH. Di sisi lain, eukariota hanya mengandung homolog MutS dan MutL. Pada manusia, heterodimer homolog MutS, MSH2-MSH6 mengikat ketidakcocokan sementara MSH2-MSH6 dan MSH2-MSH3 dapat mengikat loop penyisipan/penghapusan. Kemudian, untaian yang baru disintesis didegradasi, menghilangkan ketidakcocokan oleh aksi EXO1. Setelah itu, resintesis DNA dan ligasi melengkapi ketidakcocokan.
Yang perlu anda ketahui tentang Perbaikan Eksisi Nukleotida?
Perbaikan eksisi nukleotida (NER) adalah mekanisme perbaikan DNA untuk menghilangkan dan mengganti nukleotida yang rusak. Umumnya, mekanisme ini mendeteksi dan memperbaiki kerusakan DNA, yang mendistorsi heliks ganda DNA. Itu adalah; jalur ini mendeteksi nukleotida dan memodifikasi dengan kelompok kimia besar yang melekat pada DNA seperti bahan kimia dalam asap rokok. Selanjutnya, jalur perbaikan eksisi nukleotida memperbaiki kerusakan DNA yang disebabkan oleh radiasi UV. Di sini, radiasi UV membuat basa timin dan sitosin bereaksi dengan nukleotida yang berdekatan. Namun, ikatan yang dihasilkan mendistorsi heliks ganda, menyebabkan kesalahan dalam replikasi DNA. Di sini, jenis ikatan yang paling umum adalah dimer timin, yang terdiri dari dua nukleotida timin yang direaksikan bersama.
Gambar 2: Perbaikan Eksisi Nukleotida
Selain itu, dua subjalur perbaikan eksisi nukleotida adalah perbaikan genom global (GGR) , yang memperbaiki kerusakan pada genom keseluruhan, dan perbaikan berpasangan transkripsi (TCR) , yang secara khusus memperbaiki untaian gen aktif yang ditranskripsi. Namun, kedua jalur ini menggunakan faktor yang berbeda untuk langkah pengenalan awal. Setelah itu, faktor transkripsi perekrutan, TFIIH memiliki dua domain dengan aktivitas helikase dengan polaritas yang berlawanan untuk melepaskan DNA di sekitar lesi. Kemudian, faktor transkripsi pengikat kedua memotong kerusakan dari ujung 3′ dan 5′. Dari sana, fragmen sepanjang 24-32 nukleotida dilepaskan. Akhirnya, perbaikan diselesaikan dengan sintesis DNA dan ligasi.
Persamaan Antara Perbaikan Ketidakcocokan dan Perbaikan Eksisi Nukleotida
- Perbaikan ketidakcocokan dan perbaikan eksisi nukleotida adalah dua jenis mekanisme perbaikan DNA.
- Fungsi utamanya adalah untuk mencegah mutasi dan perubahan permanen lainnya dalam urutan DNA.
- Enzim melakukan kedua proses tersebut.
Perbedaan Antara Perbaikan Ketidakcocokan dan Perbaikan Eksisi Nukleotida
Definisi
Perbaikan ketidakcocokan (MMR) adalah istilah untuk sistem perbaikan DNA di mana satu anggota dari pasangan basa yang tidak cocok diubah menjadi basa yang biasanya cocok sementara perbaikan eksisi nukleotida (NER) adalah istilah untuk jalur utama yang digunakan oleh mamalia untuk menghilangkan lesi DNA yang besar seperti yang dibentuk oleh sinar UV.
Makna
Sel menjalani perbaikan ketidakcocokan segera setelah sintesis DNA sementara sel menjalani perbaikan eksisi nukleotida dengan terjadinya kerusakan DNA.
Jenis Perbaikan
Perbaikan ketidakcocokan menggantikan ketidakcocokan dan loop penyisipan/penghapusan, yang tidak diperbaiki dengan proofreading sementara perbaikan eksisi nukleotida menggantikan kerusakan DNA yang dibentuk oleh radiasi UV atau bahan kimia dalam asap rokok.
Eksisi oleh
Exonuclease 1 mengeluarkan DNA yang tidak cocok dalam mekanisme perbaikan ketidakcocokan sementara faktor transkripsi, XPG dan XPF-ERCC1 mengeluarkan DNA yang rusak dalam mekanisme perbaikan eksisi nukleotida.
Kata terakhir
Perbaikan ketidakcocokan adalah mekanisme perbaikan DNA, menggantikan ketidakcocokan dan loop penyisipan/penghapusan yang tergabung selama replikasi DNA. Umumnya, ketidakcocokan ini adalah yang lolos selama proofreading. Di sisi lain, perbaikan eksisi nukleotida adalah mekanisme lain dari perbaikan DNA, yang menggantikan DNA yang rusak dengan radiasi UV. Maka dari itu, perbaikan ketidakcocokan terjadi tepat setelah replikasi DNA. Namun, mekanisme perbaikan eksisi nukleotida terjadi dengan terjadinya kerusakan DNA. Fungsi utama dari kedua mekanisme tersebut adalah untuk mencegah mutasi dan perubahan permanen lainnya pada DNA. Dengan demikian, Perbedaan yang menonjol antara perbaikan mismatch dan perbaikan eksisi nukleotida adalah jenis perbaikannya.
Sumber bacaan:
- Flek, O. “Perbaikan DNA.” Jurnal Ilmu Sel , vol. 117, tidak. 4, 2004, hlm. 515–517., doi: 10.1242/jcs.00952 .
Sumber gambar:
- ” Perbaikan ketidakcocokan DNA Ecoli ” Oleh Kenji Fukui ( CC BY 4.0 ) melalui Commons Wikimedia 2. ” Jurnal Perbaikan Eksisi Nukleotida.pbio.0040203.g001 ” Oleh Jill O. Fuss, Priscilla K. Cooper ( CC BY 2.5 ) melalui Commons Wikimedia
