Sitosin adalah salah satu dari lima basa nitrogen yang merupakan bagian dari asam nukleat (DNA dan RNA) dan dalam kode genetik itu diwakili oleh huruf C.
Sitosin adalah basa pirimidin, yang mengandung cincin aromatik heterosiklik dan dua substituen yang melekat (gugus amino pada posisi 4 dan gugus keton pada posisi 2).
Bersama dengan adenin dan guanin, sitosin hadir dalam DNA dan RNA, kasus timin dan urasil berbeda, karena timin biasanya hanya dalam DNA dan urasil hanya ada dalam RNA.
Basa lainnya
Empat basa lainnya adalah adenin, guanin, timin, dan urasil. Sitosin dalam DNA selalu berpasangan dengan guanin, yang membentuk nukleosida sitidin (Cyd) dan deoksitidin (dCyd), dan nukleotida sitidilat (CMP) dan deoxycytidylate (dCMP).
Sitosin adalah turunan pirimidin, dengan cincin aromatik dan gugus amino pada posisi 4 dan gugus keton pada posisi 2.
Nama sitosin
Nama-nama lain dari sitosin adalah 2-oxy-4-aminopyrimidine dan 4-amino-2 (1H) -pyrimidinone. Rumus kimia sitosin adalah C4H5N3O dan massa molekulnya adalah 111,10 u. Sitosin ditemukan pada tahun 1894 ketika diisolasi dalam jaringan timus.
Apa itu senyawa heterosiklik?
Senyawa heterosiklik adalah senyawa organik yang mengandung struktur berbentuk cincin yang terdiri dari atom karbon dan sulfur, oksigen atau nitrogen; dan substituen adalah atom atau kelompok atom yang menggantikan atom hidrogen dalam rantai utama hidrokarbon.
Basa purin dan pirimidin dalam DNA
Nukleotida adalah senyawa organik yang terbuat dari basa nitrogen, gula, dan asam fosfat. Nukleotida diklasifikasikan menjadi ribonukleotida (Urasil – Adenin – Sitokin – Guanin) jika mengandung ribosa dan deoksiribonukleotida (Timin – Adenin – Guanin – sitokin) jika gula deoksiribosa.
Nukleotida dapat bertindak dalam beberapa cara, sebagai monomer dalam asam nukleat (DNA dan RNA) atau sebagai molekul bebas (dalam kasus ATP).
Basa nitrogen yang membentuk nukleotida diklasifikasikan sebagai basa purik atau purin dan basa pirimidin.
Purin terdiri dari dua cincin, satu dari lima dan satu dari enam atom, sehingga lebih besar dan lebih berat dari pirimidin. Mereka terbentuk oleh kondensasi dua siklus karbon dan nitrogen. DNA dan RNA mengandung dua basa murni, adenin dan guanin.
Pirimidin mengandung cincin tunggal enam atom dan lebih kecil dari purin.
Pirimidin adalah senyawa organik, yang strukturnya mirip dengan benzena, tetapi dengan cincin heterosiklik, yaitu dua atom karbon disubstitusi oleh atom nitrogen pada posisi 1 dan 3.
Tiga dari lima basa asam nukleat (C, T dan U) adalah pirimidin. Dalam DNA, basa-basa ini membentuk ikatan hidrogen dengan purin komplementernya.
Setiap rantai 3 basa nitrogen disebut triplet dan kode untuk asam amino. Artinya, enzim membaca kode dan membentuk bagian protein sesuai dengan kode masing-masing. Demikian juga, kode triplet diatur dalam gen, yang membentuk rantai DNA, yang dibungkus dalam kromosom yang terletak di inti sel eukariotik.
Nukleosida sitosin
Adapun strukturnya, terbukti bahwa dengan tiga situs pengikatannya, penyatuan dengan guanin dalam DNA dipermudah, mampu membentuk nukleosida cytidine (Cyd) dan deoxycytidine (dCyd), dan nukleotida cytidylate (CMP) dan deoxycytidylate (dCMP).
Namun, penyatuan ini secara inheren tidak stabil, dan dapat berubah menjadi urasil. Yaitu, sebuah mutasi dapat terjadi jika tidak diperbaiki oleh enzim perbaikan DNA seperti uracilglycosylase.
Di sisi lain, sitosin juga dapat didenaturasi dalam 5-metilsitosin oleh enzim yang disebut DNA metiltransferase; Juga telah ditunjukkan bahwa ia mungkin merupakan bagian dari nukleotida selain yang terkait dengan DNA atau RNA.
Sama seperti Citidine trifosfat yang bertindak sebagai kofaktor terhadap enzim, dan dapat mentransfer fosfat untuk mengubah ADP (adenosin difosfat) menjadi ATP (adenosin trifosfat).
Ciri, Karakteristik dan sifat fisik sitosin
- Ini adalah senyawa organik nitrogen dari rumus C4H5N3O
- Massa molekul: 111,10 U.M.A
- Singkatan: C
- Nama lain: 2-oxy-4-aminopyrimidine dan 4-amino-2 (1H) -pyrimidinone
- Titik lebur: 593-598 K
- Kelarutan dalam air: 1g / 130 ml air
Fungsi Sitosin
Ketika ditemukan ketiga dalam kodon RNA, sitosin identik dengan urasil, karena dapat dipertukarkan sebagai basa ketiga. Ketika ditemukan sebagai bas kedua dalam kodon, yang ketiga selalu dipertukarkan. Misalnya, UCU, UCC, UCA, dan UCG semuanya serin, terlepas dari basa ketiga.
Deaminasi enzimatik aktif dari sitosin atau 5-metilsitosin oleh keluarga APOBEC dari sitosin deaminase dapat memiliki implikasi yang menguntungkan dan merugikan pada berbagai proses seluler serta pada evolusi organisme. Implikasi deaminasi pada 5-hydroxymethylcytosine, di sisi lain, masih kurang dipahami.
