Perbedaan yang menonjol antara eksom dan transkriptom adalah eksom adalah urutan lengkap semua ekson dalam gen penyandi protein dalam genom sedangkan transkriptom adalah kumpulan molekul RNA pembawa pesan yang berasal dari gen penyandi protein. Lebih lanjut, eksom mencakup 1-2% dari total urutan genom sementara transkriptom membentuk kurang dari 4% dari total RNA sel.
Eksom dan transkriptom adalah dua kumpulan sekuens dalam gen penyandi protein dalam genom. Keduanya memiliki berbagai aplikasi dalam studi genomik serta dalam diagnosis penyakit.
Topik bahasan kami tentang:
- Apa itu Exome – Pengertian, Fakta, Teknik 2. Apa itu Transkriptom – Pengertian, Fakta, Teknik 3. Apa Persamaan Antara Exome dan Transkriptom – Garis Besar Ciri-ciri Umum 4. Apa Perbedaan Antara Exome dan Transcriptome – Perbandingan Perbedaan Kunci
Istilah Utama
Ekson, Exome, mRNA, Gen Pengkode Protein, Transkriptom
Yang perlu anda ketahui tentang Exome?
Eksom adalah kumpulan ekson dalam gen penyandi protein genom organisme tertentu. Urutan pengkodean genom dikelompokkan menjadi gen, yang dapat dikodekan untuk protein atau RNA. Dalam genom prokariotik, urutan pengkodean tidak terganggu oleh urutan lain sedangkan pada genom eukariotik, urutan pengkodean gen terganggu oleh urutan non-coding yang disebut intron. Maka dari itu, urutan pengkodean berkerumun disebut ekson.
Gambar 1: Ekson dan Intron
Dalam gen penyandi protein, RNA polimerase mentranskripsikan intron serta ekson ke dalam mRNA prekursor selama transkripsi. Intron yang tergabung dihapus selama modifikasi pasca-transkripsi berikut. Teknologi utama yang digunakan dalam studi exome adalah whole-exome sequencing (WES). WES terlibat dalam hibridisasi DNA yang terfragmentasi dari genom tertentu untuk mengidentifikasi sekuens DNA target diikuti dengan sekuensing.
Yang perlu anda ketahui tentang Transkriptom?
Transkriptom adalah kumpulan total mRNA yang diekspresikan dalam sel. Ini menyumbang kurang dari 4% dari total RNA sel. Karena transkriptom menentukan komposisi proteom, transkriptom menentukan kapasitas biokimia sel tertentu. Juga, transkriptom sel tertentu tidak dapat disintesis dan selalu datang ke sel anak dari sel induk selama pembelahan sel. Jadi, transkripsi, yang merupakan proses menghasilkan RNA adalah langkah untuk pemeliharaan transkriptom.
Gambar 2: Transkriptom Sel Pluripoten
Di sisi lain, meskipun setiap sel mengandung informasi untuk produksi seluruh transkriptom spesies, gen pengekspresi dalam sel bergantung pada faktor lingkungan juga. Dua teknologi utama yang digunakan dalam studi transkriptom adalah microarray dan RNA-seq .
Persamaan Antara Exome dan Transkriptom
- Eksom dan transkriptom adalah dua set urutan nukleotida yang ditemukan dalam genom.
- Keduanya terkait dengan informasi dalam gen penyandi protein.
- Mereka terdiri dari ekson.
Perbedaan Antara Exome dan Transkriptom
Definisi
Exome adalah istilah untuk bagian genom yang terdiri dari ekson, yang mengkode informasi untuk sintesis protein sementara transkriptom adalah istilah untuk jumlah total semua molekul RNA pembawa pesan yang diekspresikan dalam gen suatu organisme. Perbedaan yang menonjol antara eksom dan transkriptom dengan demikian cukup jelas dari definisi ini.
Makna
Maka dari itu, eksom adalah set total ekson dalam gen pengkode protein sedangkan transkriptom adalah set total mRNA yang diekspresikan dalam sel.
DNA atau RNA
Juga, eksom terdiri dari DNA sedangkan transkriptom terdiri dari RNA.
Jumlah
Exome mewakili 1-2% dari total genom sementara transkriptom mewakili kurang dari 4% dari total RNA sel.
Tingkat
Perbedaan lain antara eksom dan transkriptom adalah eksom berada di tingkat genomik sedangkan transkriptom berada di tingkat transkripsi.
Teknik
Selanjutnya, sekuensing seluruh eksom adalah teknik untuk menentukan eksom sementara microarray dan RNA-seq menentukan transkriptom.
Kata terakhir
Eksom adalah seluruh rangkaian ekson dalam genom yang ditentukan oleh WES genom. Maka dari itu, exome adalah konsep berbasis DNA. Tapi, transkriptom adalah konsep berbasis RNA karena merupakan seluruh rangkaian mRNA sel. Perbedaan yang menonjol antara eksom dan transkriptom adalah konsepnya.
Sumber bacaan:
- Warr, Amanda dkk. “Pengurutan Exome: Perspektif Saat Ini dan Masa Depan.” G3: Gen|Genom|Genetika 5.8 (2015): 1543–1550. PMC. Web. 6 September 2018. Tersedia Di Sini 2. Coklat TA. genom. edisi ke-2. Oxford: Wiley-Liss; 2002. Bab 3, Transkriptom dan Proteom. Tersedia disini
Sumber gambar:
- ” DNA ekson intron ” Oleh National Human Genome Research Institute – ( Domain Publik ) melalui Commons Wikimedia 2. “Transkriptom sel pluripoten” Oleh Grskovic, M. dan Ramalho-Santos, M., Transkriptom pluripoten (10 Oktober 2008), StemBook, ed. Komunitas Penelitian Sel Punca, StemBook, doi/10.3824/stembook.1.24.1, http://www.stembook.org. – [1] DirectStemBook Gambar 2 Transkriptom sel pluripoten. Grskovic, M. dan Ramalho-Santos, M., Transkriptom pluripoten (10 Oktober 2008), StemBook, ed. Komunitas Penelitian Sel Punca, StemBook, doi/10.3824/stembook.1.24.1, http://www.stembook.org. ( CC BY 3.0 ) melalui Commons Wikimedia
