Perbedaan yang menonjol antara hibridisasi koloni dan plak adalah hibridisasi koloni adalah metode yang digunakan dalam pemilihan koloni bakteri dengan gen yang diinginkan sedangkan hibridisasi plak adalah metode pemilihan fag dengan gen yang diinginkan. Selanjutnya, hibridisasi koloni dapat digunakan dalam penyaringan perpustakaan berbasis plasmid – atau kosmid sementara hibridisasi plak dapat digunakan dalam penyaringan perpustakaan fag .
Hibridisasi koloni dan plak adalah dua teknik yang digunakan dalam penyaringan perpustakaan genomik atau cDNA. Mereka juga disebut pengangkatan koloni dan pengangkatan plak .
Topik bahasan kami tentang:
- Apa Itu Hibridisasi Koloni – Pengertian, Jenis Pustaka, Metode Penyaringan 2. Apa Itu Hibridisasi Plak – Pengertian, Jenis Pustaka, Metode Penyaringan 3. Apa Persamaan Antara Hibridisasi Koloni dan Plak – Garis Besar Karakteristik Umum 4. Apa Itu Perbedaan Antara Hibridisasi Koloni dan Plak – Perbandingan Perbedaan Utama
Istilah Utama
Koloni, Hibridisasi Koloni, Penyaringan Perpustakaan, Plak, Hibridisasi Plak
Yang perlu anda ketahui tentang Hibridisasi Koloni?
Hibridisasi koloni adalah metode penyaringan yang digunakan dalam pemilihan koloni bakteri dengan urutan DNA yang diinginkan. Ini juga disebut hibridisasi bercak koloni, pengangkatan koloni atau pelapisan replika . Ini memungkinkan penyaringan koloni berlapis dengan kepadatan tinggi. Prosedur asli hibridisasi koloni pertama kali dikembangkan oleh Grunstein dan Hogness. Pertama, koloni bakteri dapat diubah menjadi membran dan koloni bakteri dilisiskan, memperlihatkan asam nukleat. Kemudian, asam nukleat yang terpapar difiksasi ke membran dengan mendenaturasinya dan dihibridisasi dengan probe radioaktif.
Gambar 1: Metode Hibridisasi Koloni
Koloni adalah sekelompok bakteri yang dikembangkan dari sel bakteri tunggal melalui reproduksi aseksual. Maka dari itu, semua sel bakteri dalam koloni tertentu memiliki susunan genetik yang sama serta materi genetik yang diubah. Umumnya, bakteri ditransformasikan dengan bantuan vektor plasmid atau kosmid.
Yang perlu anda ketahui tentang Hibridisasi Plak?
Hibridisasi plak adalah metode penyaringan untuk fag rekombinan. Ini adalah modifikasi dari hibridisasi koloni oleh Benton dan Devis pada tahun 1977. Metode ini juga disebut pengangkatan plak . Prosedur hibridisasi plak mirip dengan prosedur hibridisasi koloni dan plak diangkat dengan mengontakkannya ke membran nitroselulosa. Asam nukleat kemudian diekspos dan difiksasi ke membran, hibridisasi dengan probe yang diinginkan.
Gambar 2: Plak pada Piring Agar
Plak adalah zona bening pada lempeng agar yang dihasilkan oleh bakteriofag tertentu melalui lisis sel bakteri pada area tersebut. Karena jumlah DNA yang ditransfer ke membran nitroselulosa lebih sedikit, hibridisasi plak menghasilkan lebih sedikit sinyal latar belakang.
Persamaan Antara Hibridisasi Koloni dan Plak
- Hibridisasi koloni dan plak adalah dua teknik yang digunakan dalam penyaringan perpustakaan genomik atau cDNA.
- Prinsip utama dalam kedua teknik adalah hibridisasi asam nukleat.
- Keduanya adalah metode hibridisasi filter, yang memungkinkan penyaringan utama perpustakaan dengan replikasi in Situ pada membran nitroselulosa.
- Mereka memungkinkan penyaringan kepadatan tinggi.
- Molekul DNA untai tunggal digunakan sebagai probe, yang dapat berhibridisasi ke urutan komplementernya untuk mengidentifikasi urutan spesifik.
- Kedua teknik hibridisasi ini cepat dan dapat menangani klon dalam jumlah yang sangat besar.
- Mereka digunakan dalam identifikasi urutan gen yang tidak lengkap, yang tidak dapat diekspresikan.
Perbedaan Antara Hibridisasi Koloni dan Plak
Definisi
Hibridisasi koloni adalah istilah untuk metode pemilihan koloni bakteri dengan gen yang diinginkan sedangkan hibridisasi plak adalah istilah untuk metode penyaringan yang digunakan dalam identifikasi fag rekombinan.
Dikembangkan oleh
Hibridisasi koloni pertama kali dikembangkan oleh Grunstein dan Hogness sedangkan hibridisasi plak pertama kali dikembangkan oleh Benton dan Devis pada tahun 1977.
Jenis Perpustakaan
Hibridisasi koloni melibatkan identifikasi perpustakaan berbasis plasmid atau kosmid sementara hibridisasi plak melibatkan identifikasi perpustakaan fag.
Jumlah Lift
Koloni dapat diangkat untuk satu kali sementara plak dapat diangkat beberapa kali.
Sinyal Latar Belakang
Sinyal latar belakang lebih banyak terjadi pada hibridisasi koloni sedangkan sinyal latar belakang lebih sedikit pada hibridisasi plak.
Kata terakhir
Hibridisasi koloni adalah metode penyaringan koloni bakteri di perpustakaan yang dihasilkan dengan vektor plasmid atau kosmid. Di sisi lain, hibridisasi plak adalah metode penyaringan bakteriofag di perpustakaan fag. Perbedaan yang menonjol antara hibridisasi koloni dan plak adalah jenis perpustakaan yang disaring dalam setiap metode.
Sumber bacaan:
- Kaksonen, Anna. “Pendekatan Molekuler untuk Analisis Komunitas Mikroba.” Leaching – BioMineWiki, 20 April 2006, Tersedia di sini 2. Dale, JW, dan PJ Greenaway. “Identifikasi Fag Rekombinan dengan Hibridisasi Plak.” Metode dalam Biologi Molekuler (Clifton, NJ)., Perpustakaan Kedokteran Nasional AS, Tersedia Di Sini
Sumber gambar:
- “Hibridisasi Blot” Oleh Kaksonen – http://wiki.biomine.skelleftea.se/biomine/molecular/index_22.htm ( Domain Publik ) melalui Commons Wikimedia 2. “M. plakat smegmatis” Oleh Wazzzup7up – Karya sendiri ( Domain Publik ) via Commons Wikimedia
