Perbedaan Utama – Plasmid vs Transposon
Plasmid dan transposon adalah dua jenis unsur genetik seluler, yang masing-masing terlibat dalam transfer materi genetik antara genom dan kromosom . Urutan penyisipan (IS) dan episom adalah jenis lain dari unsur genetik seluler. Plasmid adalah molekul DNA ekstra-kromosom, replikasi diri yang secara alami terjadi pada bakteri sementara transposon adalah urutan DNA yang bergerak di sekitar posisi berbeda dalam genom. Plasmid biasanya beruntai ganda, molekul melingkar. Transposon disebut ‘ gen melompat ‘, dan mereka dapat menyebabkan mutasi dan perubahan jumlah DNA dalam genom. Perbedaan yang menonjol antara plasmid dan transposon adalah plasmid mentransfer materi genetik antara genom sedangkan transposon mentransfer materi genetik antara kromosom dalam genom yang sama .
Topik bahasan kami tentang:
- Apa itu Plasmid – Definisi, Kelas, Karakteristik 2. Apa itu Transposon – Definisi, Kelas, Karakteristik 3. Apa Persamaan Antara Plasmid dan Transposon – Garis Besar Karakteristik Umum 4. Apa Perbedaan Antara Plasmid dan Transposon – Perbandingan Perbedaan Kunci
Istilah Kunci: Plasmid Kol, Plasmid Konjugatif, Plasmid Degradatif, Transposon DNA, Plasmid F, Gen Lompat, Unsur Genetik Seluler, Plasmid, Plasmid Resistensi, Retrotransposon, Transposase, Transposon, Plasmid Virulensi
Yang perlu anda ketahui tentang Plasmid?
Plasmid adalah istilah untuk unsur genetik yang bereplikasi secara independen dari kromosom. Plasmid adalah molekul DNA melingkar beruntai ganda, terjadi di sitoplasma bakteri, archaea , ragi , dan protozoa . Ukuran plasmid dapat bervariasi dari 1 – 1.000 kbp. Satu hingga ribuan jenis plasmid yang berbeda dapat diidentifikasi dalam berbagai jenis sel. Fungsi utama plasmid di alam adalah untuk terlibat dalam konjugasi, yang merupakan mekanisme transfer gen horizontal (HGT). HGT adalah istilah untuk pergerakan materi genetik antar organisme.
Meskipun plasmid terdapat pada bakteri, plasmid tidak diperlukan untuk kelangsungan hidup bakteri dalam kondisi normal. Mereka berisi informasi yang diperlukan untuk resistensi antibiotik, resistensi logam, fiksasi nitrogen, dan produksi toksin. Plasmid alami dapat dimodifikasi dengan teknik in vitro seperti transformasi kode. Plasmid adalah jenis vektor yang digunakan sebagai kendaraan untuk membawa informasi genetik ke sel kedua. Sebuah vektor plasmid ditunjukkan pada Gambar 1 .
Gambar 1: pBR322
Karakteristik Plasmid
- Dapat mereplikasi diri di dalam sel
- Dapat dengan mudah diisolasi dari sel
- Memiliki situs restriksi yang unik untuk satu atau lebih enzim restriksi
- Penyisipan potongan DNA asing mungkin tidak mengubah sifat replikasinya
- Dapat secara berurutan diperkenalkan kembali ke sel baru dan transforman dapat dipilih
- Jangan terjadi secara bebas di alam
Klasifikasi Plasmid
Plasmid dapat diklasifikasikan dalam beberapa cara. Berdasarkan mekanisme konjugasinya, plasmid dapat diklasifikasikan menjadi plasmid konjugatif dan non-konjugatif. Plasmid konjugatif terdiri dari satu set transfer ( tra ) gen, dikodekan untuk pili seks , mempromosikan konjugasi (reproduksi seksual) bakteri. Transformasi plasmid dari satu bakteri ke bakteri lain terjadi melalui pili seks. Plasmid non-konjugatif ditransfer dengan bantuan plasmid konjugatif. Konjugasi bakteri ditunjukkan pada gambar 2.
Gambar 2: Konjugasi
Lima kelas plasmid juga dapat diidentifikasi berdasarkan fungsinya:
- P-plasmid F – Plasmid F mengandung tra. Dengan demikian, mereka mampu mengekspresikan pili seks selama konjugasi.
- Plasmid resistensi – Plasmid resistensi mengandung gen yang memberikan resistensi terhadap antibiotik atau racun. Mereka secara historis dikenal sebagai faktor-R sebelum sifat plasmid dipahami.
- Col plasmid – Col plasmid mengandung gen yang mengkode bakteriosin, protein yang dapat membunuh bakteri lain.
- Plasmid degradatif – Plasmid degradatif memungkinkan pencernaan zat yang tidak biasa seperti toluena dan asam salisilat.
- Plasmid virulensi – Plasmid virulensi mengubah bakteri menjadi patogen.
Yang perlu anda ketahui tentang Transposon?
Transposon adalah istilah untuk segmen kromosom yang dapat ditranslokasikan antara DNA kromosom, plasmid atau fag. Transposon juga dikenal sebagai unsur transposable (TE) . Transposisi terjadi tanpa adanya urutan komplementer dalam DNA inang. Transposon menyebabkan mutasi pada genom. Selama transposisi, ukuran genom dapat ditingkatkan atau dikurangi. Karena transposon mungkin mengandung gen, mereka dikenal sebagai gen pelompat.
Klasifikasi Transposon
Dua kelas transposon adalah retrotransposon dan transposon DNA. Siklus hidup retrotransposon ditunjukkan pada gambar 3.
Gambar 3: Siklus Retrotransposon
Retrotransposon melakukan transpos melalui perantara RNA menggunakan metode ‘salin dan tempel’; salinan RNA dari segmen DNA dibuat pada awalnya, dan kemudian ditranskripsikan secara terbalik menjadi segmen DNA. Pengulangan terminal panjang ( LTR ) dan pengulangan terminal pendek ( STR ) adalah dua jenis retrotransposon. Kebanyakan retrotransposon adalah LTR. Transposon LTR menunjukkan struktur dan fungsi yang mirip dengan retrovirus. Sebuah transposon LTR ditunjukkan pada gambar 4.
Gambar 4: Transposon LTR
Transposon DNA transpos melalui metode ‘potong-dan-tempel’; transposon dipotong dari satu posisi genom dan dimasukkan ke posisi lain. Transposase adalah enzim yang terlibat dalam transposisi DNA. Sebuah transposon DNA bakteri ditunjukkan pada gambar 5.
Gambar 5: Transposon DNA Bakteri
Transposon DNA diapit oleh dua terminal inverted repeats (TIRs), yang dikenali oleh transposase untuk eksisi. Setelah penyisipan, DNA di situs target diduplikasi, membentuk duplikasi situs target (TSD). Mekanisme transposisi DNA ditunjukkan pada Gambar 6.
Gambar 6: Transposisi DNA
Di kedua kelas transposon, unsur non-otonom yang tidak mengkode protein yang dibutuhkan oleh mobilisasi transposon mungkin ada. Maka dari itu, transposon ini mungkin bergantung pada transposon otonom untuk mobilitasnya. Sebagai contoh, unsur-unsur transposable-repeat-repeat mini mini ( MITEs ) adalah unsur-unsur mirip transposon DNA pendek (80-500 bp). Mereka terutama hadir pada eukariota, terutama pada spesies tumbuhan. Meskipun mereka memiliki TIR dan diapit oleh TSD, MITEs tidak memiliki gen pengkode transposase. Dengan demikian, MITE mungkin bergantung pada transposon DNA otonom untuk mobilisasinya.
Persamaan Antara Plasmid dan Transposon
- Plasmid dan transposon adalah dua jenis unsur genetik bergerak, yang terlibat dalam transfer materi genetik antara genom dan kromosom.
- Baik plasmid dan transposon terdiri dari DNA beruntai ganda.
- Baik plasmid maupun transposon terjadi secara alami di dalam sel.
Perbedaan Antara Plasmid dan Transposon
Definisi
Plasmid: Plasmid adalah istilah untuk unsur genetik yang bereplikasi secara independen dari kromosom.
Transposon: Transposon adalah istilah untuk segmen kromosom yang dapat ditranslokasikan antara DNA kromosom, plasmid atau fag.
Makna
Plasmid: Plasmid adalah molekul DNA ekstra-kromosom, replikasi diri, yang terjadi secara alami pada bakteri.
Transposon: Transposon adalah urutan DNA yang bergerak di sekitar posisi yang berbeda dalam genom.
Kejadian
Plasmid: Plasmid secara alami terjadi pada bakteri dan beberapa sel eukariotik.
Transposon: Transposon terjadi pada bakteri dan semua sel eukariotik.
Kelas
Plasmid: Plasmid F, plasmid resistensi, plasmid col, plasmid degradatif, dan plasmid virulensi adalah lima kelas plasmid.
Transposon: Retrotransposon dan transposon DNA adalah dua kelas transposon.
Replikasi diri
Plasmid: Plasmid dapat mereplikasi
diri di dalam sel.
Transposon: Transposon bukanlah segmen DNA yang dapat mereplikasi diri.
Karakteristik karakteristik
Plasmid: Plasmid terdiri dari asal replikasi, promotor, gen resistensi antibiotik, dan beberapa situs kloning.
Transposon: Transposon terdiri dari daerah pengkode untuk transposase, gen transposabel, dan pengulangan terminal.
Vektor
Plasmid: Plasmid digunakan sebagai vektor untuk menghasilkan DNA rekombinan.
Transposon: Transposon digunakan sebagai vektor untuk menyisipkan beberapa basa dalam mutagenesis penyisipan.
Perubahan Genom
Plasmid: Plasmid dapat digunakan untuk memasukkan gen baru ke dalam genom organisme lain.
Transposon: Transposon adalah mutagen yang terkadang menyebabkan penyakit genetik.
Kata terakhir
Plasmid dan transposon adalah dua jenis unsur genetik seluler yang mentransfer segmen DNA. Baik plasmid maupun transposon terjadi secara alami di dalam sel. Plasmid adalah molekul DNA melingkar yang dapat mereplikasi diri, terutama ditemukan pada bakteri. Mereka dapat digunakan untuk mentransfer gen antar genom. Transposon adalah segmen DNA yang bergerak di sekitar posisi yang berbeda dalam genom. Perbedaan yang menonjol antara plasmid dan transposon adalah perannya; plasmid mentransfer materi genetik antar genom sedangkan transposon mentransfer materi genetik antara kromosom dalam genom yang sama.
Sumber bacaan:
- “Plasmid.” Mikrobiologi Tanpa Batas, Tersedia di sini . 2. Muñoz-López, Martín, dan José L. García-Pérez. “Transposon DNA: Sifat dan Aplikasi dalam Genomik.” Genomik Terkini, Bentham Science Publishers Ltd., Apr. 2010, Tersedia di sini .
Sumber gambar:
- “PBR322” Oleh Ayacop (+ Yikrazuul) – Karya sendiri (Domain Publik) melalui Commons Wikimedia 2. “Konjugasi” Oleh Adenosin – Karya sendiri (CC BY-SA 3.0) melalui Commons Wikimedia 3. “Retrotransposon” Oleh Mariuswalter – Milik kerja (CC BY-SA 4.0) melalui Commons Wikimedia 4. “Transposon komposit” Oleh Jacek FH – buatan sendiri, berdasarkan Gambar:Composite transposon.jpg (CC BY-SA 3.0) melalui Commons Wikimedia 5. “DNA Transposon” Oleh Mariuswalter – Karya sendiri (CC BY-SA 4.0) melalui Commons Wikimedia
