Perbedaan yang menonjol antara STBR Green dan Taqman adalah SYBR green adalah pewarna pengikat dsDNA yang digunakan untuk mendeteksi produk PCR yang terakumulasi selama reaksi PCR sedangkan Taqman adalah probe fluorogenik khusus untuk gen target, yang terakumulasi selama PCR. Selanjutnya, SYBR Green memiliki spesifisitas sedang sedangkan Taqman memiliki spesifisitas tinggi. Selain itu, reproduktifitas SYBR Green juga sedang sedangkan reproduktifitas Taqman tinggi.
SYBR Green dan Taqman adalah dua kimia yang digunakan untuk mendeteksi produk PCR secara real-time prosedur PCR.
Topik bahasan kami tentang:
- Apa itu SYBR Green – Pengertian, Kimia, Kegunaan 2. Apa itu Taqman – Pengertian, Kimia, Kepentingan 3. Apa Persamaan Antara SYBR Green dan Taqman – Garis Besar Ciri-ciri Umum 4. Apa Perbedaan Antara SYBR Green dan Taqman – Perbandingan Perbedaan Kunci
Istilah Utama
Deteksi Produk, PCR Real-Time, SYBR Green, Taqman Probe
Yang perlu anda ketahui tentang SYBR Green?
SYBR Green adalah pewarna pengikat dsDNA yang digunakan untuk mewarnai DNA dan RNA dalam biologi molekuler. Umumnya, juga digunakan untuk mendeteksi produk PCR real-time. Selama kemajuan PCR, SYBR green mengikat setiap produk PCR yang baru diperkuat. Maka dari itu, pada akhir PCR, jumlah produk yang terbentuk sebanding dengan intensitas fluoresensi sampel.
Gambar 1: Kimia Hijau SYBR
Lebih jauh lagi, keuntungan utama SYBR Green adalah memungkinkan pemantauan amplifikasi sekuens DNA untai ganda. Namun, ini, di sisi lain, mengurangi spesifisitas pengujian dengan menghasilkan sinyal positif palsu. Ini mengurangi biaya pengujian dengan menghilangkan penggunaan probe. Selain itu, penggunaan SYBR Green secara teknis merupakan proses yang mudah. Sementara itu, pengikatan beberapa pewarna ke produk PCR tunggal meningkatkan sensitivitas deteksi.
Yang perlu anda ketahui tentang Taqman?
Taqman adalah probe, yang berlabel fluoresensi dan secara khusus mengikat produk PCR target dalam PCR waktu nyata. Maka dari itu, perlu dirancang probe khusus untuk mendeteksi uji PCR tertentu. Dengan demikian, keuntungan utama dari probe Taqman adalah hibridisasi spesifik targetnya. Selain itu, penggunaan probe yang diberi label dengan pewarna reporter yang berbeda dan dapat dibedakan memungkinkan pendeteksian dua urutan berbeda dalam satu tabung reaksi.
Gambar 2: Kimia Penyelidik Taqman
Umumnya, probe Taqman adalah probe oligonukleotida dengan pewarna reporter fluoresen pada ujung 5′ dan pewarna quencher pada ujung 3. Ketika probe utuh, kedekatan pewarna quencher sangat mengurangi fluoresensi yang dipancarkan oleh pewarna reporter oleh transfer energy resonansi fluoresensi (FRET). Namun, ketika probe menyatu dengan urutan target hilir dari salah satu situs primer, aktivitas 5′ nuklease dari Taq DNA polimerase memotong ujung 5′ probe selama ekstensi primer. Maka dari itu, ini memisahkan pewarna reporter dari pewarna quencher, meningkatkan sinyal pewarna reporter.
Persamaan Antara SYBR Green dan Taqman
- SYBR Green dan Taqman adalah dua kimia pendeteksi produk PCR secara real-time PCR.
- Keduanya mengikat produk PCR secara real-time.
- Selain itu, mereka membantu untuk mengukur produk PCR pada setiap siklus PCR.
- Mereka penting untuk analisis ekspresi gen , kuantisasi DNA, ChiP (kromatin imunopresipitasi), dll.
Perbedaan Antara SYBR Hijau dan Taqman
Definisi
SYBR Green adalah istilah untuk pewarna sianin asimetris yang digunakan sebagai pewarna asam nukleat dalam biologi molekuler sementara Taqman adalah istilah untuk probe, yang dirancang untuk meningkatkan spesifisitas PCR kuantitatif.
Makna
Selain itu, SYBR green adalah pewarna pengikat dsDNA yang digunakan untuk mendeteksi produk PCR yang terakumulasi selama reaksi PCR sementara Taqman adalah probe fluorogenik khusus untuk gen target, yang terakumulasi selama PCR. Jadi, inilah Perbedaan yang menonjol antara SYBR Green dan Taqman.
Jenis Deteksi
Juga, sementara SYBR Green dapat digunakan untuk mendeteksi produk PCR real-time tanpa spesifisitas urutan, probe Taqman hanya mendeteksi produk PCR dengan cara spesifik urutan.
Rancangan
SYBR Green tidak perlu predesign sedangkan Taqman harus predesign untuk deteksi produk PCR tertentu.
Optimasi
Selanjutnya, SYBR Green harus dioptimalkan untuk PCR real-time tertentu, sedangkan Taqman tidak perlu dioptimalkan.
Kekhususan
Perbedaan lain antara SYBR Green dan Taqman adalah SYBR Green memiliki spesifisitas sedang sedangkan Taqman memiliki spesifisitas tinggi.
Kepekaan
Sensitivitas SYBR Green bervariasi sedangkan sensitivitas Taqman hingga 1-10 eksemplar.
Penghambatan PCR
SYBR Green dapat menghambat reaksi PCR sampai batas tertentu, sedangkan Taqman tidak menghambat reaksi PCR.
Reproduksibilitas
Reproduksibilitas SYBR Green juga sedang sedangkan reproduktifitas Taqman tinggi.
Multiplexing
Selain itu, SYBR Green tidak dapat digunakan dalam multiplexing sementara Taqman memungkinkan pendeteksian beberapa produk PCR dalam sampel yang sama.
Aplikasi
SYBR Green penting untuk analisis ekspresi gen, kuantisasi DNA dalam deteksi patogen, dll. Sementara Taqman penting untuk genotipe SNP, deteksi variasi jumlah salinan seperti pada mutasi, analisis protein, dll.
Kata terakhir
Singkatnya, SYBR Green adalah pewarna pengikat dsDNA yang digunakan untuk mendeteksi produk PCR secara real-time PCR. Umumnya, ia mengikat semua produk PCR dalam sampel dengan cara yang tidak spesifik. Maka dari itu, spesifisitasnya sedang. Di sisi lain, Taqman adalah probe berlabel fluoresensi, yang secara khusus mengikat produk PCR tertentu dalam sampel. Maka dari itu, probe ini bervariasi dengan jenis sampel. Selain itu, ini memberikan spesifisitas yang tinggi untuk pengujian. Maka dari itu, Perbedaan yang menonjol antara SYBR Green dan Taqman adalah kimia dan keunggulannya.
Sumber bacaan:
- “Kimia TaqMan vs SYBR.” Thermo Fisher Scientific , Thermo Fisher Scientific – AS, Tersedia Di Sini .
Sumber gambar:
- “PCR dengan SYBR green” Oleh –Ygonaar 23:09, 7 Maret 2006 (UTC) – Ini adalah grafik yang dibuat oleh Ygonaar dengan Powerpoint ( CC BY-SA 3.0 ) melalui Commons Wikimedia 2. “Taqman” Oleh Pengguna: Braindamaged – Karya sendiri oleh pengunggah asli (Domain Publik) melalui Commons Wikimedia
