Cara Membedakan VNTR dan STR

Perbedaan Utama – VNTR vs STR

DNA berulang adalah pola asam nukleat yang terjadi dalam banyak salinan di seluruh genom . Mereka membuat proporsi utama dari DNA nuklir pada eukariota . Pengulangan tandem adalah salah satu jenis utama dari DNA berulang yang menyalin unit urutan berulang yang terletak berdekatan satu sama lain, membentuk blok nukleotida . VNTR (pengulangan tandem nomor variabel) dan STR (pengulangan tandem pendek) adalah dua jenis pengulangan tandem yang ditemukan dalam genom eukariotik. VNTR adalah jenis DNA minisatelit sedangkan STR adalah jenis DNA mikrosatelit. Perbedaan yang menonjol antara VNTR dan STR adalah unit berulang dari VNTR adalah 10-60 pasangan basa sedangkan unit berulang dari STR adalah 2-6 pasangan basa .

Topik bahasan kami tentang:

1. Apa itu VNTR – Pengertian, Karakteristik, Kegunaan 2. Apa itu STR – Pengertian, Karakteristik, Kepentingan 3. Apa Persamaan Antara VNTR dan STR – Garis Besar Karakteristik Umum 4. Apa Perbedaan Antara VNTR dan STR – Perbandingan Perbedaan Kunci

Istilah Kunci: Genetika Forensik, Mikrosatelit, Minisatelit, Unit Nukleotida Berulang, STR, Pengulangan Tandem, VNTR

Yang perlu anda ketahui tentang VNTR

VNTR adalah istilah untuk jenis pengulangan tandem di mana urutan pendek nukleotida (10-60 pasangan basa) diulang beberapa kali variabel di lokus tertentu . Maka dari itu, VNTR juga dikenal sebagai minisatelit . VNTR diselingi di seluruh kromosom genom eukariotik. Umumnya, jumlah unit berulang dalam VNTR bervariasi antar individu. Maka dari itu, panjang array yang dibentuk oleh VNTR juga bervariasi antar individu. Karena jumlah varian kromosom diwarisi dari orang tua, mereka dapat digunakan dalam identifikasi orang tua atau pribadi. Variasi VNTR pada enam individu ditunjukkan pada Gambar 1 .

Gambar 1: Variasi VNTR pada Individu

VNTR adalah jenis polimorfisme pertama yang digunakan dalam pembuatan profil DNA untuk menentukan karakteristik DNA orang tertentu. Mereka juga digunakan sebagai penanda genetik dalam RFLP (restriction fragment length polymorphism), suatu teknik yang menggunakan PCR , elektroforesis gel, dan produksi pola pita oleh south blotting.

Yang perlu anda ketahui tentang STR

STR adalah istilah untuk jenis pengulangan tandem di mana urutan pendek nukleotida (2-6 pasangan basa) diulang beberapa kali variabel di lokus tertentu. STR adalah jenis mikrosatelit, dan mereka juga dikenal sebagai pengulangan urutan pendek (SSR) dalam genetika tanaman. Unit berulang yang terdiri dari nukleotida tunggal dikenal sebagai polimorfisme nukleotida tunggal (SNP). STR adalah jenis polimorfisme genetik yang paling umum dianalisis saat ini dalam genetika forensik. Profil DNA dengan menggunakan STR sebagai penanda genetik ditunjukkan pada Gambar 2.

Gambar 2: Profil DNA

Mutasi di beberapa daerah STR menyebabkan penyakit genetik seperti sindrom X rapuh dan penyakit Huntington.

Persamaan Antara VNTR dan STR

• VNTR dan STR adalah dua jenis pengulangan tandem.
• Baik VNTR dan STR adalah wilayah struktural genom eukariotik.
• Baik VNTR dan STR terdiri dari DNA noncoding.
• Baik VNTR dan STR diwarisi dari orang tua.
• Baik VNTR dan STR terdiri dari urutan berulang, mengatur berdekatan satu sama lain dalam sebuah array.
• Baik VNTR dan STR menghasilkan polimorfisme genetik.
• Baik VNTR dan STR tersebar di seluruh genom.
• Baik VNTR dan STR digunakan sebagai penanda genetik dalam genetika forensik.
• Mutasi pada VNTR dan STR menyebabkan penyakit genetik.

Perbedaan Antara VNTR dan STR

Definisi

VNTR: VNTR adalah jenis pengulangan tandem di mana urutan pendek nukleotida (10-60 pasangan basa) diulang beberapa kali variabel di lokus tertentu.

STR: STR adalah jenis pengulangan tandem di mana urutan pendek nukleotida (2-6 pasangan basa) diulang beberapa kali variabel di lokus tertentu.

Jumlah Nukleotida Berulang

VNTR: VNTR terdiri dari 10-60 pasangan basa.

STR: STR terdiri dari 2-6 pasangan basa.

Jenis DNA Berulang

VNTR: VNTR adalah sejenis DNA minisatelit.

STR: STR adalah sejenis DNA mikrosatelit.

Jumlah Pengulangan

VNTR: VNTR terdiri dari 10-1.500 pengulangan dalam array.

STR: STR terdiri dari 5-200 pengulangan dalam array.

Ukuran Array

VNTR: VNTR membentuk array 0,5-15 kb.

STR: STR membentuk array 10-1000 bp.

Kompleksitas Array

VNTR: VNTR menghasilkan array yang heterogen.

STR: STR menghasilkan susunan yang homogen.

Kata terakhir

VNTR dan STR adalah dua jenis pengulangan tandem yang membentuk susunan unit berulang yang berdekatan dalam genom eukariotik. VNTR terdiri dari unit nukleotida berulang yang relatif panjang (10-60 pasangan basa). STR terdiri dari unit nukleotida berulang pendek (2-6 bp). Perbedaan yang menonjol antara VNTR dan STR adalah panjang unit pengulangan dari setiap jenis pengulangan tandem.

Sumber bacaan:

1. “Ulangi tandem nomor variabel.” Topik ScienceDirect, Tersedia di sini. 2. “Ilmu Genetika Forensik.” CRG – Dewan untuk Genetika yang Bertanggung Jawab, Tersedia di sini .

Sumber gambar:

1. “D1S80Demo” Oleh PaleWhaleGail di Wikipedia bahasa Inggris (CC BY-SA 3.0 ) melalui Commons Wikimedia 2. “Stages of Gene Fingerprinting” Oleh Sneptunebear16 – Karya sendiri (CC BY-SA 4.0) melalui Commons Wikimedia