Perbedaan yang menonjol antara elektroforesis gel dan SDS PAGE adalah elektroforesis gel adalah teknik yang digunakan untuk memisahkan DNA , RNA , dan protein sedangkan SDS PAGE adalah jenis elektroforesis gel yang digunakan terutama untuk memisahkan protein. Secara umum, SDS PAGE memberikan resolusi yang lebih baik daripada elektroforesis gel biasa.
Elektroforesis Gel dan SDS PAGE adalah teknik dalam bioteknologi yang membantu pemisahan makromolekul berdasarkan muatan dan ukurannya. Biasanya, elektroforesis gel menggunakan tusukan gel agarosa untuk pemisahan sementara SDS PAGE menggunakan tusukan gel poliakrilamida.
Topik bahasan kami tentang:
- Apa itu Elektroforesis Gel – Pengertian, Prosedur, Pentingnya 2. Apa itu SDS PAGE – Pengertian, Prosedur, Pentingnya 3. Apa Persamaan Antara Elektroforesis Gel dan SDS PAGE – Garis Besar Karakteristik Umum 4. Apa Perbedaan Antara Elektroforesis Gel dan SDS PAGE – Perbandingan Perbedaan Utama
Istilah Kunci: Agarosa, DNA, Elektroforesis Gel, Poliakrilamida, Protein, SDS PAGE
Yang perlu anda ketahui tentang Elektroforesis Gel?
Elektroforesis gel merupakan teknik pemisahan fragmen makromolekul seperti DNA, RNA, dan protein berdasarkan ukuran dan muatannya. Selama elektroforesis gel, makromolekul bergerak di bawah pengaruh medan listrik pada matriks gel, yang berisi pori-pori tempat makromolekul bergerak. Elektroforesis gel adalah teknik umum yang menganalisis DNA dari teknik PCR , RFLP, kloning, sekuensing DNA atau blotting. Nanopartikel juga dapat dipisahkan dengan elektroforesis gel. Gel stab dibuat dari polisakarida yang disebut agarosa yang berasal dari rumput laut. Gel agarosa terdiri dari molekul agarosa rantai panjang yang saling terkait sebagai jaring laba-laba. Video 1 menjelaskan persiapan gel agarosa.
Baik DNA dan RNA mengandung gugus fosfat pada masing-masing nukleotida monomernya. Maka dari itu, mereka memiliki muatan negatif yang sama di seluruh molekul. Selain itu, mereka bermigrasi menuju elektroda positif di bawah medan listrik. Kecepatan migrasi tergantung pada ukuran asam nukleat. Molekul yang lebih pendek bermigrasi lebih cepat melalui pori-pori sementara yang lebih besar membutuhkan waktu.
Gambar 1: Pita DNA pada Gel Agarosa
Yang perlu anda ketahui tentang HALAMAN SDS?
SDS PAGE (elektroforesis gel natrium dodesil sulfat-poliakrilamida) adalah teknik analisis yang digunakan untuk memisahkan molekul bermuatan berdasarkan ukurannya. Dalam proses ini, SDS digunakan untuk mengisolasi protein dengan mendenaturasinya. Karena SDS adalah deterjen; struktur tersier protein terganggu olehnya, membawa protein yang terlipat menjadi molekul linier. Juga, ia melapisi molekul protein linier itu dengan muatan negatif yang seragam. SDS PAGE terdiri dari dua gel dengan konsentrasi yang berbeda. Lapisan atas disebut gel susun tempat sampel dimuat sedangkan lapisan bawah disebut gel pengurai. Konsentrasi poliakrilamida gel susun adalah 3,5-4% (ukuran pori besar) dan mengkonsentrasikan protein dalam satu pita. Konsentrasi poliakrilamida dalam gel pelarut adalah 4-20% (ukuran pori kecil) dan memisahkan protein berdasarkan ukurannya. Video 2 menunjukkan persiapan HALAMAN SDS.
SDS PAGE menyediakan pemisahan protein yang cepat, membantu analisis selanjutnya seperti Western blotting.
Gambar 2: Pita Protein pada SDS PAGE
Karena daya pisah SDS PAGE lebih tinggi daripada gel agarosa biasa, SDS PAGE membantu memisahkan fragmen DNA kecil dengan ukuran 5-500 bp.
Persamaan Antara Elektroforesis Gel dan SDS PAGE
- Elektroforesis gel dan SDS PAGE adalah teknik yang memisahkan makromolekul berdasarkan muatan dan ukurannya.
- Kedua teknik menggunakan tusukan gel dengan pori-pori kecil di mana makromolekul bergerak.
- Gaya penggerak adalah beda potensial antara dua elektroda.
Perbedaan Antara Elektroforesis Gel dan SDS PAGE
Definisi
Elektroforesis Gel: Teknik yang digunakan untuk memisahkan fragmen makromolekul seperti DNA, RNA, dan protein berdasarkan ukuran dan muatannya
SDS PAGE: Teknik analisis yang digunakan untuk memisahkan molekul bermuatan berdasarkan ukurannya
Komposisi
Elektroforesis Gel: Sama di seluruh gel; terbuat dari agarosa
HALAMAN SDS: Dua gel dengan konsentrasi berbeda; terbuat dari poliakrilamida
Jalankan Konfigurasi
Elektroforesis Gel: Lari horizontal
HALAMAN SDS: lari vertikal
Metodologi Pengecoran
Elektroforesis Gel: Tetapkan saat dingin
HALAMAN SDS: Ditetapkan oleh reaksi kimia
Ukuran Pori
Elektroforesis Gel: Ukuran pori tidak seragam; semakin tinggi konsentrasi agarosa, semakin kecil ukuran pori
HALAMAN SDS: Ukuran pori seragam; rasio akrilamida dengan bis-akrilamida menentukan ukuran pori
Konsentrasi
Elektroforesis Gel: 0,5-2%
HALAMAN SDS: 6-15%
Pemisahan
Elektroforesis Gel: asam nukleat 50-20.000 bp
HALAMAN SDS: Protein 5-250.000 Da
Kondisi
Elektroforesis Gel: Umumnya dijalankan dalam kondisi asli
HALAMAN SDS: Kondisi denaturasi
Persiapan
Elektroforesis Gel: Sederhana
HALAMAN SDS: Proses yang kompleks
pewarnaan
Elektroforesis Gel: Dengan etidium bromida
HALAMAN SDS: Pewarnaan Coomassie atau pewarnaan perak
Kata terakhir
Elektroforesis gel merupakan teknik analisis yang memisahkan makromolekul seperti DNA, RNA, dan protein berdasarkan ukurannya. SDS PAGE adalah jenis elektroforesis gel yang terutama digunakan untuk memisahkan protein dalam kondisi denaturasi. SDS PAGE memiliki daya pisah yang lebih tinggi jika dibandingkan dengan elektroforesis gel biasa. Perbedaan yang menonjol antara elektroforesis gel dan SDS PAGE adalah jenis makromolekul yang dipisahkan dan prosedurnya.
Sumber bacaan:
- “Elektroforesis Gel.” Khan Academy, Tersedia Di Sini 2. “SDS Polyacrylamide Gel Electrophoresis (SDS-PAGE).” Diamantina Institute, 26 April 2017, Tersedia Di Sini
Sumber gambar:
- “Gel elektroforesis 2” Von Mnolf – Foto diambil di Innsbruck, Austria ( CC BY-SA 3.0 ) melalui Commons Wikimedia 2. “Coomassie3” Oleh Yikrazuul – Karya sendiri ( CC BY-SA 3.0 ) melalui Commons Wikimedia
