Perbedaan yang menonjol antara penyambungan RNA dan penyambungan alternatif adalah penyambungan RNA adalah proses penyambungan ekson transkrip utama mRNA sedangkan penyambungan alternatif adalah proses menghasilkan kombinasi diferensial ekson dari gen yang sama . Selanjutnya, penyambungan RNA bertanggung jawab untuk produksi molekul mRNA yang dapat diterjemahkan menjadi protein sementara penyambungan alternatif bertanggung jawab untuk produksi berbagai protein dari transkrip primer yang sama.
Penyambungan RNA dan penyambungan alternatif adalah dua jenis modifikasi pasca-transkripsi yang mengikuti transkripsi gen eukariotik. Keduanya penting untuk produksi protein fungsional.
Topik bahasan kami tentang:
- Apa itu Penyambungan RNA – Definisi, Proses, Pentingnya 2. Apa Itu Penyambungan Alternatif – Pengertian, Proses, Pentingnya 3. Apa Persamaan Antara Penyambungan RNA dan Penyambungan Alternatif – Garis Besar Karakteristik Umum 4. Apa Perbedaan Antara Penyambungan RNA dan Penyambungan Alternatif – Perbandingan Perbedaan Kunci
Istilah Utama
Penyambungan Alternatif, Ekson, Intron, Modifikasi Pasca Transkripsi, Penyambungan RNA
Yang perlu anda ketahui tentang Penyambungan RNA
Penyambungan RNA adalah proses biologis yang menghilangkan intron dari transkrip RNA primer sambil mengikat ekson bersama-sama dalam eukariota. Pada manusia, panjang rata-rata gen adalah 30.000 pasangan basa, tetapi panjang molekul mRNA yang matang kurang dari 20.000 pasangan basa. Penyambungan RNA bertanggung jawab atas pengurangan panjang rata-rata molekul mRNA ini. Fungsi utama dari proses splicing RNA adalah produksi molekul mRNA matang dari transkrip RNA primer, yang dapat diterjemahkan menjadi protein fungsional.
Gambar 1: Penyambungan RNA
Umumnya, setiap intron dimulai dengan GU dan diakhiri dengan AG pada arah 5′ hingga 3′. Yang pertama adalah situs donor splicing sedangkan yang kedua adalah situs akseptor splicing . Situs ketiga yang disebut situs cabang terjadi 20 – 50 basa hulu ke situs akseptor dengan urutan konsensus situs cabang “CU(A/G)A(C/U)”, di mana A dilestarikan di semua gen. Ketiga situs ini secara kolektif dikenal sebagai sinyal penyambungan . Selain itu, urutan ekson situs donor adalah (A/C)AG di sebagian besar kasus, dan urutan ekson di situs akseptor adalah G.
Gambar 2: Mekanisme Dua Langkah Penyambungan RNA
Lima molekul snRNA dan protein terkaitnya membentuk protein ribonuklear yang disebut splicosom , yang merupakan kompleks besar (60S). Splicosom bertanggung jawab untuk menghilangkan intron dari transkrip RNA primer dalam proses dua langkah. Sementara itu, splicing Konstitutif adalah mekanisme splicing RNA umum.
Yang perlu anda ketahui tentang Penyambungan Alternatif
Penyambungan alternatif adalah proses biologis yang bertanggung jawab untuk produksi molekul mRNA varian dari transkrip RNA primer tertentu dari gen tertentu. Itu berarti; ekspresi gen tunggal dapat menghasilkan banyak protein dengan bantuan splicing alternatif. Maka dari itu, molekul mRNA matang ini mungkin kekurangan beberapa ekson dalam transkrip RNA primer. Karena urutan asam amino dari protein ini berbeda satu sama lain, mereka menggunakan fungsi biologis yang berbeda di dalam sel. Meskipun genom manusia terdiri dari 25.000-35.000 gen penyandi protein, lebih dari 90.000 protein disintesis sebagai hasil penyambungan alternatif. Selain itu, beberapa protein yang disintesis dari transkrip RNA tertentu disebut isoform protein.
Gambar 3: Gambaran Penyambungan Alternatif
Ada lima mode dasar splicing alternatif. Mereka adalah loncatan ekson atau ekson alternatif tipe kaset, ekson yang saling eksklusif, situs sambungan 3′ alternatif, situs sambungan 5′ alternatif, dan retensi intron . Pola splicing alternatif yang paling umum pada vertebrata dan invertebrata adalah skipping ekson. Dalam metazoa bawah, itu adalah retensi intron.
Gambar 4: Mekanisme Penyambungan Alternatif
Persamaan Antara Penyambungan RNA dan Penyambungan Alternatif
- Penyambungan RNA dan penyambungan alternatif adalah dua jenis modifikasi pasca-transkripsi yang terjadi selama ekspresi gen eukariotik .
- Namun, molekul efektor untuk kedua proses adalah transkrip RNA primer.
- Juga, keduanya terlibat dalam penyambungan ekson dengan menghilangkan intron.
- Selanjutnya, keduanya bertanggung jawab untuk produksi molekul mRNA, yang dapat diterjemahkan menjadi protein fungsional.
- Selain itu, kedua proses terjadi di dalam nukleus.
Perbedaan Antara Penyambungan RNA dan Penyambungan Alternatif
Definisi
Penyambungan RNA adalah istilah untuk modifikasi transkrip RNA pra-pesan (pre-mRNA) yang baru lahir di mana intron dihilangkan dan ekson digabungkan sebelum terjemahan. Padahal, splicing alternatif adalah istilah untuk proses yang memungkinkan messenger RNA (mRNA) untuk mengarahkan sintesis varian protein yang berbeda (isoform) yang mungkin memiliki fungsi atau sifat seluler yang berbeda. Definisi ini menjelaskan perbedaan mendasar antara penyambungan RNA dan penyambungan alternatif.
Fungsi
Penyambungan RNA menyambung ekson transkrip RNA primer sementara penyambungan alternatif menyambung ekson dalam transkrip RNA primer, membentuk kombinasi diferensial ekson. Maka dari itu, ini adalah perbedaan fungsional antara penyambungan RNA dan penyambungan alternatif.
ekson
Selain itu, mRNA matang yang dihasilkan oleh penyambungan RNA mengandung semua ekson dalam transkrip primer sedangkan mRNA matang yang dihasilkan oleh penyambungan alternatif tidak mengandung setiap ekson dari transkrip RNA primer.
Hasil dalam
Perbedaan lain antara penyambungan RNA dan penyambungan alternatif adalah hasil penyambungan. Penyambungan RNA menghasilkan molekul mRNA, yang dapat diterjemahkan menjadi protein fungsional sementara penyambungan alternatif menghasilkan varian mRNA yang berbeda, yang dapat diterjemahkan ke dalam isomer protein yang berbeda.
Pentingnya
Perbedaan antara penyambungan RNA dan penyambungan alternatif berdasarkan kepentingannya adalah penyambungan RNA menyatukan daerah pengkode protein dengan menghapus daerah non-pengkode dari transkrip utama sementara penyambungan alternatif meningkatkan keragaman informasi dan keragaman proteomik sel.
Kata terakhir
RNA splicing adalah proses ligasi ekson dari pre mRNA eukariotik dengan menghilangkan intron. Di sisi lain, splicing alternatif adalah produksi beberapa mRNA dari satu pra mRNA oleh kombinasi diferensial ekson. Fungsi utama penyambungan RNA adalah menghasilkan mRNA matang, yang dapat diterjemahkan menjadi protein fungsional. Sebaliknya, splicing alternatif menghasilkan isomer protein dengan fungsi diferensial. Maka dari itu, Perbedaan yang menonjol antara penyambungan RNA dan penyambungan alternatif adalah mekanisme dan kepentingannya.
Sumber bacaan:
- E, Zhiguo dkk. “Penyambungan dan penyambungan alternatif pada beras dan manusia” Laporan BMB vol. 46,9 (2013): 439-47. Tersedia Di Sini 2. “Penyambungan RNA.” MoBio, Penerbitan Buku Web, Tersedia Di Sini 3. Wang, Yan et al. “Mekanisme penyambungan alternatif dan pengaturannya” Laporan biomedis vol. 3,2 (2014): 152-158. Tersedia disini
Sumber gambar:
- “Diagram splicing RNA en” Oleh LadyofHats – membuat diri saya berdasarkan pada informasi yang ditemukan di wikipedia plus :[1]dan[2]. (Domain Publik) melalui Commons Wikimedia 2. “Reaksi penyambungan RNA” Oleh BCSteve – Karya sendiri ( CC BY-SA 3.0 ) melalui Commons Wikimedia 3. “Penyambungan alternatif DNA” Oleh National Human Genome Research Institute – http://www.genome.gov/Images/EdKit/bio2j_large.gif (Domain Publik) melalui Commons Wikimedia 4. “RNA Splicing” Oleh OpenStax CNX ( CC BY 3.0 ) melalui OpenStax Collage
