Perbedaan yang menonjol antara enzim restriksi dan endonuklease restriksi adalah enzim restriksi adalah “gunting molekuler” yang memotong DNA pada atau mendekati urutan pengenalan spesifik yang dikenal sebagai situs restriksi, sedangkan restriksi endonuklease adalah salah satu kelas dari kelompok enzim endonuklease .
Enzim restriksi dan restriksi endonuklease adalah dua nama untuk enzim yang bertanggung jawab untuk membelah DNA di situs tertentu yang disebut situs pengenalan restriksi.
Topik bahasan kami tentang:
- Apa itu Enzim Restriksi?
- Definisi, Struktur, Fungsi
- Apa itu Endonuklease Restriksi?
- Definisi, Struktur, Fungsi
- Persamaan Antara Enzim Restriksi dan Endonuklease Restriksi
- Garis Besar Karakteristik Umum
- Perbedaan Antara Enzim Pembatasan dan Pembatasan Endonuklease
- Perbandingan dengan Perbedaan Kunci
Istilah Utama
Endonuklease Restriksi, Enzim Restriksi, DNA Beruntai Ganda
Yang perlu anda ketahui tentang Enzim Restriksi?
Enzim restriksi atau endonuklease restriksi adalah kelompok luas enzim endonuklease yang membelah DNA di tempat tertentu. Situs pengenalan untuk pembelahan DNA adalah situs restriksi. Selain itu, ada lima jenis enzim restriksi: tipe 1, 2, 3, 4, dan 5. Di sini, klasifikasinya adalah dengan metode pembelahan substrat DNA di tempat pengenalannya.
Enzim Pembatasan Tipe 1
Enzim restriksi tipe 1 adalah kompleks, enzim multi-subunit dengan aktivitas restriksi dan metilase dalam kombinasi. Selanjutnya, pertama kali diidentifikasi pada strain E. coli. Ini berisi tiga subunit yang berbeda: HsdR, HsdM, dan HsdS. HsdR mengalami pencernaan restriksi, sementara HsdM mengalami metilasi, dan HsdS penting untuk pengenalan situs pengenalan dan situs metilasi. Selain itu, enzim restriksi 1 memotong DNA pada lokasi yang berada pada jarak acak lebih dari 1000 bp dari situs pengenalan restriksi. Pembelahan acak ini juga diikuti oleh translokasi DNA karena enzim ini berfungsi sebagai motor molekuler. Gen enzim restriksi 1 lebih umum dalam genom prokariotik. Meskipun enzim restriksi tipe 1 memiliki kepentingan biokimia, ia memiliki nilai praktis yang kecil karena produksi fragmen restriksi diskrit.
Gambar 1: Aksi Enzim Pembatasan
Enzim Pembatasan Tipe 2
Enzim restriksi tipe 2 memotong DNA pada posisi tertentu yang berada di dalam atau dekat dengan situs pengenalan restriksi. Selain itu, situs pengenalannya adalah palindromik dan panjangnya 4-8 nukleotida. Umumnya, itu adalah homodimer dengan pembatasan independen dan aktivitas metilase. Pada saat yang sama, hanya membutuhkan magnesium sebagai kofaktor tanpa menggunakan ATP. Karena produksi fragmen-fragmen diskrit melalui pencernaan restriksi dengan pemotongan khusus pada atau dekat dengan tempat pengenalan, enzim restriksi tipe 2 lebih sering digunakan di laboratorium untuk analisis DNA dan kloning.
Enzim Pembatasan Tipe 3
Enzim restriksi tipe 3 adalah jenis ketiga dari enzim restriksi, mengenali dua urutan non-palindromik yang terpisah, yang berorientasi terbalik. Ini juga memotong DNA sekitar 20-30 bp hilir ke situs pengenalan. Secara umum, enzim restriksi tipe 3 merupakan heterodimer dengan dua subunit yang berbeda. Selain itu, aktivitas restriksi dan metilasi terjadi pada subunit yang sama dari enzim restriksi tipe 3. Namun, jarang memberikan pencernaan yang lengkap.
Enzim Pembatasan Tipe 4 dan 5
Enzim restriksi tipe 4, di sisi lain, menargetkan DNA yang dimodifikasi termasuk DNA termetilasi, hidroksimetilasi, dan glukosil-hidroksimetilasi. Sedangkan enzim restriksi tipe 5 menggunakan guide RNA (gRNA) sebagai substratnya.
Yang perlu anda ketahui tentang Endonuklease Restriksi?
Endonuklease restriksi adalah kelas endonuklease yang luas. Umumnya, endonuklease adalah enzim yang memutus ikatan fosfodiester dalam rantai polinukleotida. Endonuklease restriksi terjadi pada bakteri dan archaea. Selain itu, mereka melindungi organisme ini dari virus yang menyerang. Biasanya, endonuklease restriksi memotong DNA asing di dalam prokariota. Proses ini disebut pencernaan restriksi. Namun, enzim yang dimodifikasi yang disebut methyltransferase memodifikasi DNA inang dengan metilasi DNA, menghalangi pembelahan DNA inang. Dua proses pencernaan restriksi dan penyumbatan pembelahan DNA inang, dikenal sebagai sistem modifikasi restriksi.
Gambar 2: Fungsi Enzim Pembatasan
Selain itu, 3.600 endonuklease restriksi terdapat dalam 250 spesifisitas. Di antara mereka, lebih dari 800 dikomersialkan.
Persamaan Antara Enzim Restriksi dan Endonuklease Restriksi
- Enzim restriksi dan restriksi endonuklease adalah dua kelompok enzim yang membelah DNA menjadi potongan-potongan di atau dekat situs pengenalan.
- Mereka juga memiliki peran dalam melindungi prokariota dari serangan virus dengan memotong DNA asing menjadi potongan-potongan.
- Selain itu, mereka memainkan peran utama dalam biologi molekuler untuk memotong DNA untuk rekombinasi fragmen DNA.
Perbedaan Antara Enzim Pembatasan dan Pembatasan Endonuklease
Definisi
Enzim restriksi adalah istilah untuk enzim yang diproduksi terutama oleh bakteri tertentu, yang memiliki sifat membelah molekul DNA pada atau dekat urutan basa tertentu, sedangkan endonuklease restriksi adalah istilah untuk enzim yang memotong DNA menjadi fragmen pada atau dekat situs pengenalan spesifik dalam molekul yang dikenal sebagai situs pembatasan.
Pembelahan
Enzim restriksi membelah DNA pada sekuens nukleotida tertentu sedangkan endonuklease restriksi membelah DNA untai ganda.
Pentingnya
Selain itu, enzim restriksi penting dalam bioteknologi dalam kloning sementara endonuklease restriksi melindungi sel prokariotik dari patogen yang menyerang.
Kata terakhir
Singkatnya, enzim restriksi dan restriksi endonuklease adalah dua jenis endonuklease yang membelah DNA pada atau dekat sekuens spesifik: situs restriksi. Namun, enzim restriksi adalah kelompok endonuklease yang penting dalam bioteknologi untuk membelah DNA untuk kloning. Di sisi lain, endonuklease restriksi penting dalam prokariota untuk membelah DNA asing untuk melindungi dari virus yang menyerang. Maka dari itu, Perbedaan yang menonjol antara enzim restriksi dan restriksi endonuklease adalah kepentingannya.
Sumber bacaan:
- Yayasan Wikimedia. (2022, 15 Juni). Enzim restriksi . Wikipedia, ensiklopedia gratis. Diakses pada 7 Agustus
- Yayasan Wikimedia. (2022, 29 April). Endonuklease . Wikipedia, ensiklopedia gratis. Diakses pada 7 Agustus
Sumber gambar:
- ” Situs Pembatasan HindIII dan Vektor Ujung Lengket” Oleh Helixitta – Karya Sendiri ( CC BY-SA 4.0 ) melalui Commons Wikimedia Commons
- ” Pembentukan plasmid rekombinan ” oleh Minestrone Soup – Pekerjaan Sendiri ( CC BY-SA 3.0 ) melalui Commons Wikimedia Commons
