Perbedaan yang menonjol antara GFP dan YFP adalah GFP menunjukkan warna hijau saat terpapar cahaya berkisar dari biru hingga ultraviolet sedangkan YFP menunjukkan warna kuning saat terpapar cahaya yang sama . Selanjutnya, GFP awalnya berasal dari ubur-ubur, Aequorea Victoria sedangkan YFP adalah mutan genetik protein GFP.
GFP (protein fluoresen hijau) dan YFP (protein fluoresen kuning) adalah dua jenis protein fluoresen, yang menunjukkan warna fluoresen yang berbeda pada paparan rentang cahaya dari biru hingga kisaran ultraviolet. Namun, aplikasi mereka dalam biologi molekuler adalah sama.
Topik bahasan kami tentang:
- Apa itu GFP – Pengertian, Karakteristik, Aplikasi 2. Apa itu YFP – Pengertian, Karakteristik, Aplikasi 3. Apa Persamaan GFP dan YFP – Garis Besar Karakteristik Umum 4. Apa Perbedaan GFP dan YFP – Perbandingan Perbedaan Kunci
Istilah Utama
Protein Fluorescent, GFP (protein fluorescent hijau), Derivatif GFP, YFP (protein fluorescent kuning)
Yang perlu anda ketahui tentang GFP?
GFP (green fluorescent protein) adalah protein polipeptida bioluminescent yang secara alami terdapat pada ubur-ubur, Aequorea Victoria , dan banyak organisme laut lainnya. Di Aequorea Victoria , ia dikenal sebagai aequorin dan memancarkan fluoresensi ketika terkena cahaya biru hingga ultraviolet. Itu berarti; GFP sepenuhnya menyerap cahaya biru (475 nm) atau cahaya 395 nm dalam rentang UV panjang dan memancarkan cahaya hijau (509 nm).
Gambar 1: Aequorea Victoria
Protein GFP mengandung 238 asam amino dan ukuran proteinnya adalah 26,9 kDa. Ini lipatan untuk membentuk bentuk beta-barrel. Di sini, bagian protein yang membuatnya berpendar terbentuk dari konjugasi atom rantai utama, Ser65, Tyr66, dan Gly67, membentuk kromofor p-hydroxybenzylideneimidazolinone planar yang sangat terkonjugasi dengan adanya oksigen. Kromofor dikemas di dalam struktur beta-barrel, melindungi kromofor dari pendinginan melalui oksigen paramagnetik, dipol air, atau isomerisasi cis-trans. Juga, interaksi non-kovalen kromofor dengan molekul tetangga meningkatkan sifat spektralnya.
Gambar 2: Struktur GFP
Selanjutnya, GFP digunakan dalam biologi molekuler sebagai reporter ekspresi gen , membuktikan ekspresi gen asing di dalam organisme inang. Juga, dapat digunakan untuk menentukan lokasi sub-seluler di mana protein tertentu akan diekspresikan. Di sini, protein yang diinginkan menyatu dengan GFP dan protein fusi ini diubah menjadi inang.
Gambar 3: Ekspresi EGFP
Namun, kelemahan utama dengan GFP tipe liar adalah efektivitasnya yang berkurang karena pelipatan efisiensi rendah pada suhu fisiologis seperti 37 ° C, menjatuhkan sinyal fluoresen. Juga, tingkat pematangan GFP yang rendah memungkinkan protein untuk berkumpul di dalam sel. Enhanced GFP ( EGFP ) adalah turunan dari GFP tipe liar dengan mutan titik efisiensi lipat (F64L) 37 °C ke perancah yang dihasilkan oleh mutasi titik tunggal (S65T) dengan karakteristik spektral yang ditingkatkan termasuk peningkatan fluoresensi, fotostabilitas, dan pergeseran puncak eksitasi utama menjadi 488 nm, dengan emisi puncak dipertahankan pada 509 nm.
Yang perlu anda ketahui tentang YFP?
YFP (protein fluoresen kuning) adalah turunan GFP yang diperkenalkan sebagai mutasi genetik. Sebenarnya, itu adalah mutan warna yang dicapai oleh mutasi T203Y. Hal ini menghasilkan interaksi penumpukan elektron antara residu tirosin tersubstitusi dan kromofor. Maka dari itu, YFP menyerap cahaya warna hijau pada panjang gelombang 514 nm sedangkan memancarkan cahaya warna kuning pada 527 nm.
Gambar 4: Derivatif GFP
Selain itu, Citrine, Venus, dan YPet adalah tiga versi YFP yang ditingkatkan. Mereka datang dengan sifat bersama termasuk sensitivitas klorida berkurang, pematangan lebih cepat, dan peningkatan kecerahan. Kepentingan utama YFP dalam biologi molekuler adalah sebagai akseptor untuk sensor FRET (Förster resonance energy transfer) yang dikodekan secara genetik. Di sini, protein fluoresen donor yang paling umum adalah protein fluoresen cyan monomer (mCFP), yang merupakan turunan GFP lainnya.
Persamaan Antara GFP dan YFP
- GFP dan YFP adalah dua jenis protein fluoresen dengan aplikasi serupa dalam biologi molekuler.
- Keduanya dapat memancarkan fluoresensi saat terpapar cahaya, yang berkisar dari biru hingga kisaran ultraviolet.
- Gen protein fluoresen digunakan sebagai reporter ekspresi gen.
- Juga, protein ini dapat diekspresikan di dalam berbagai organisme termasuk manusia, mamalia, ikan, jamur, ragi, dan sel bakteri.
- Selain itu, gen protein fluoresen dimasukkan ke dalam sel inang melalui teknologi DNA rekombinan .
Perbedaan Antara GFP dan YFP
Definisi
GFP adalah istilah untuk protein yang bersinar hijau di bawah lampu neon dan ditemukan secara alami di ubur-ubur, Aequorea Victoria, sedangkan YFP adalah istilah untuk mutan genetik protein fluorescent hijau (GFP). Jadi, inilah perbedaan mendasar antara GFP dan YFP.
Berdiri untuk
GFP adalah singkatan dari green fluorescent protein sedangkan YFP adalah singkatan dari yellow fluorescent protein.
Memancarkan Warna di bawah UV
Seperti namanya, Perbedaan yang menonjol antara GFP dan YFP adalah GFP memancarkan cahaya warna hijau sedangkan YFP memancarkan cahaya warna kuning.
Kejadian
Selanjutnya, GFP secara alami terjadi di banyak organisme laut termasuk ubur-ubur, Aequorea Victoria sementara YFP adalah mutan genetik GFP. Maka dari itu, ini adalah perbedaan lain antara GFP dan YFP.
Puncak Eksitasi
Selain itu, puncak eksitasi mayor GFP berada pada 395 nm dan puncak eksitasi minor pada 475 nm sedangkan puncak eksitasi YFP berada pada 514 nm.
Puncak Emisi
Selain itu, puncak emisi GFP berada pada 509 nm sedangkan puncak emisi YFP berada pada 527 nm. Maka dari itu, ini juga merupakan perbedaan antara GFP dan YFP.
Aplikasi
Selain itu, perbedaan penting lainnya antara GFP dan YFP adalah GFP penting sebagai reporter ekspresi dan untuk memvisualisasikan lokalisasi protein yang menyatu sementara YFP digunakan sebagai biosensor pH intraseluler non-invasif atau indikator fluoresen untuk konsentrasi Ca 2+ lokal.
Kata terakhir
GFP adalah protein fluoresen yang secara alami terdapat pada ubur-ubur, Aequorea Victoria. Ini digunakan dalam biologi molekuler sebagai reporter ekspresi dan untuk memvisualisasikan lokalisasi protein yang menyatu. Umumnya, GFP memancarkan fluoresensi hijau terang saat terpapar sinar ultraviolet biru. Sebagai perbandingan, YFP adalah mutan genetik GFP, memancarkan fluoresensi kuning pada paparan sinar ultraviolet biru. Maka dari itu, Perbedaan yang menonjol antara GFP dan YFP adalah warna fluoresensi yang mereka pancarkan dan asalnya.
Sumber bacaan:
- “Protein Fluoresen Hijau (GFP).” Thermo Fisher Scientific, Thermo Fisher Scientific, Tersedia Di Sini . 2. Khetrapal, Afsaneh. “Turunan GFP: CFP dan YFP.” News-Medical.net, News Medical, 25 Jan 2019, Tersedia Disini .
Sumber gambar:
- “Aequorea victoria” Oleh Mnolf – Foto diambil di Monterey Bay Aquarium, CA, AS ( CC BY-SA 3.0 ) melalui Commons Wikimedia 2. ” PDB 1ema EBI ” Oleh Jawahar Swaminathan dan staf MSD di European Bioinformatics Institute (Domain Publik) melalui Commons Wikimedia 3. “Fgams ppat egfp puncta” Oleh Zhao A, Tsechansky M, Swaminathan J, Cook L, Ellington AD, dkk. (2013) Enzim Biosintetik Purin yang Ditransfusikan Secara Transien Membentuk Badan Stres. PLoS ONE 8(2): e56203. doi:10.1371/journal.pone.0056203 – http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0056203 ( CC BY 3.0 ) melalui Commons Wikimedia 4. “174-GFPLikeProteins GFP-like Proteins” Oleh David Goodsell – Molekul Bank Data Protein RCSB Bulan Ini ( CC BY 3.0 ) melalui Commons Wikimedia
