Cara Membedakan miRNA dan siRNA

Perbedaan Utama – miRNA vs siRNA

miRNA dan siRNA adalah dua jenis RNA non-coding yang terlibat dalam regulasi gen . Mereka juga berfungsi sebagai agen terapi kelas baru dalam perawatan kanker dan infeksi. Baik miRNA dan siRNA adalah molekul RNA dupleks pendek, yang memberikan efek pembungkaman gen dengan menargetkan messenger RNA (mRNA) pada tingkat pascatranskripsi. Meskipun fungsinya serupa dalam pembungkaman gen, mekanisme aksi dan aplikasi klinisnya berbeda satu sama lain. Perbedaan yang menonjol antara miRNA dan siRNA adalah miRNA dapat bekerja pada beberapa target mRNA, tetapi siRNA hanya bekerja pada satu target mRNA, yang sangat spesifik untuk jenis siRNA. Dengan demikian, pendekatan terapeutik miRNA dan siRNA juga berbeda satu sama lain. 

Topik bahasan kami tentang:

1. Apa itu miRNA – Definisi, Karakteristik, Fungsi 2. Apa itu siRNA – Pengertian, Karakteristik, Fungsi 3. Apa Persamaan Antara miRNA dan siRNA       – Garis Besar Karakteristik Umum 4. Apa Perbedaan Antara miRNA dan siRNA – Perbandingan Perbedaan Utama

Istilah Kunci: AGO2, Dicer, Pembungkaman Gen, MicroRNA (miRNA), pri-miRNA, RISC, RNA Interference (RNAi), Small Interfering RNA (siRNA)

Yang perlu anda ketahui tentang miRNA?

MicroRNA ( miRNA) adalah molekul RNA untai tunggal pendek, terdiri dari 19-25 nukleotida . MiRNA pertama ditemukan di C. Elegans pada tahun 1993. miRNA adalah kelas RNA kecil yang mengganggu, yang menghambat ekspresi gen pada tingkat pasca-transkripsi. Transkripsi gen miRNA dilakukan oleh RNA polimerase untuk menghasilkan miRNA primer (pri-miRNA). Pri-miRNA memiliki tutupan 5′, poliadenilasi pada ujung 3′, dan membentuk struktur loop batang beruntai ganda. Molekul pri-miRNA ini dibelah oleh kompleks mikroprosesor, membentuk prekursor miRNA (pre-miRNA). Molekul dupleks pra-miRNA terdiri dari 70-100 nukleotida. Protein Exportin 5 mengangkut molekul pra-miRNA ke dalam sitoplasma dari nukleus untuk diproses lebih lanjut menjadi miRNA oleh protein Dicer. Maka dari itu, miRNA adalah dupleks RNA, yang terdiri dari 18-25 nukleotida. Protein pemain dadu adalah jenis khusus dari enzim mirip RNase III.

Gambar 1: Pembentukan dan fungsi miRNA

Asosiasi miRNA dengan protein RNA-induced silencing complex (RISC) membentuk kompleks yang disebut miRISC. Untaian indra miRNA dilepaskan di kompleks miRISC. Kemudian, mRNA dengan urutan komplementer ke untai RNA antisense di kompleks miRISC dipilih oleh pasangan basa komplementer parsial. Pengikatan kompleks miRISC dengan mRNA target ini dapat menekan translasi, mendegradasi molekul mRNA atau memotong molekul mRNA.

Yang perlu anda ketahui tentang siRNA

RNA pengganggu kecil (siRNA) adalah jenis lain dari RNA dupleks pendek, yang membungkam ekspresi gen dengan membelah mRNA. SiRNA juga pertama kali ditemukan di C. Elegans dalam proses yang disebut interferensi RNA (RNAi) dari penghambatan gen yang efektif oleh RNA eksogen. Molekul RNA untai ganda (dsRNA) dapat dihasilkan di dalam sel dengan transkripsi gen seluler, menginfeksi patogen atau pengenalan buatan. DsRNA ini dipecah oleh protein Dicer menjadi dsRNA kecil yang dikenal sebagai siRNA. SiRNA ini memiliki panjang 21-23 nukleotida dengan dua nukleotida menggantung di ujung 3′. SiRNA dalam sitoplasma dikaitkan dengan protein RISC dan untai indera molekul siRNA dibelah oleh endonuklease yang disebut komponen argonaute 2 (AGO2) dari RISC. Molekul mRNA yang relevan dikenali oleh untai RNA antisense dari siRNA, yang masih melekat pada protein RISC. Pembelahan molekul mRNA target dilakukan oleh komponen AGO2.

Gambar 2: Pembungkaman gen oleh siRNA

Karena siRNA hanya dapat menargetkan molekul mRNA tertentu, pembungkaman ekspresi gen tertentu dapat dicapai oleh siRNA. Selain itu, karena siRNA secara alami tidak ada pada mamalia, siRNA dapat digunakan sebagai agen terapi khusus.

Persamaan Antara miRNA dan siRNA

• Baik miRNA dan siRNA adalah molekul RNA dupleks pendek.
• Baik miRNA dan siRNA adalah jenis RNA non-coding yang terlibat dalam regulasi gen
• Kedua jenis RNA memberikan efek pembungkaman gen dengan menargetkan RNA messenger pada tingkat pascatranskripsi.
• Keduanya berfungsi sebagai agen terapi kelas baru dalam perawatan kanker dan infeksi.

Perbedaan Antara miRNA dan siRNA

Definisi

miRNA: miRNA adalah segmen pendek RNA yang menekan ekspresi gen dengan mengikat segmen komplementer dari messenger RNA.

siRNA: SiRNA adalah segmen pendek RNA yang beroperasi di jalur interferensi RNA (RNAi).

Kejadian

miRNA: miRNA ditemukan pada hewan dan tumbuhan.

siRNA: SiRNA ditemukan pada hewan dan tumbuhan tingkat rendah, tetapi tidak pada mamalia.

Struktur

miRNA: miRNA adalah molekul untai tunggal panjang 18-25 nukleotida dengan dua nukleotida menggantung di ujung 3′.

siRNA: siRNA adalah molekul dupleks panjang 21-23 nukleotida dengan dua nukleotida menggantung di ujung 3′.

Sebelum Pemrosesan Pemain Dadu

miRNA: Sebelum pemrosesan dadu, miRNA berada dalam bentuk prekursor miRNA, mengandung 70-100 nukleotida dengan ketidakcocokan yang tersebar. Pra-miRNA ada dalam struktur loop jepit rambut.

siRNA: Sebelum pemrosesan dadu, siRNA adalah molekul RNA untai ganda, yang mengandung 30-100 nukleotida.

Saling melengkapi

miRNA: miRNA sebagian melengkapi mRNA. Ini terutama menargetkan daerah miRNA yang tidak diterjemahkan.

siRNA: siRNA sepenuhnya melengkapi mRNA target.

Jumlah Target mRNA

miRNA: miRNA mampu menargetkan lebih dari 100 jenis mRNA secara bersamaan.

siRNA: siRNA hanya mampu menargetkan satu jenis mRNA.

Mekanisme Regulasi Gen

miRNA: miRNA menekan terjemahan dengan degradasi mRNA. Pembelahan endonukleolitik jarang terjadi pada miRNA ketika tingkat komplementaritas yang tinggi ditemukan pada target.

siRNA: siRNA mengatur ekspresi gen dengan pembelahan endonukleolitik.

Peraturan

miRNA: MiRNA mengatur gen yang sama dari mana miRNA ditranskripsi serta banyak gen lainnya.

siRNA : siRNA hanya mengatur gen dari mana siRNA ditranskripsi.

Aplikasi Klinis

miRNA: miRNA berfungsi sebagai target obat, agen terapeutik atau alat diagnostik dan biomarker.

siRNA: SiRNA berfungsi sebagai agen terapeutik.

Kata terakhir

MiRNA dan siRNA adalah dua jenis RNA non-coding, yang terlibat dalam regulasi ekspresi gen. Baik miRNA dan siRNA adalah molekul RNA untai ganda. Kedua jenis RNA menjalani mekanisme pembungkaman gen yang serupa melalui proses yang dikenal sebagai interferensi RNA. Namun, miRNA mampu menargetkan banyak jenis RNA karena urutan miRNA melengkapi daerah mRNA yang tidak diterjemahkan. Di sisi lain, siRNA hanya mampu menargetkan jenis mRNA yang dipilih. Maka dari itu, Perbedaan yang menonjol antara miRNA dan siRNA adalah kekhususan masing-masing jenis RNA dalam interferensi RNA.

Sumber bacaan:

1. “Pengantar MiRNA (microRNA).” Sigma-Aldrich. Np, dan Web. Tersedia disini. 24 Juli 2017. 2. “Aplikasi SiRNA.” Aplikasi – siRNA | GE Dharmacon. Np, dan Web. Tersedia di sini . 24 Juli 2017. 3. “SiRNA Versus miRNA sebagai Terapi untuk Pembungkaman Gen.” Ilmu Langsung. Np, dan Web. Tersedia di sini . 24 Juli 2017.

Sumber gambar:

1. “MiRNA” Oleh Kelvinsong – Karya sendiri (CC BY 3.0) melalui Commons Wikimedia 2. “Mekanisme SiRNA.2” Oleh Singh135 – Karya sendiri (CC BY-SA 4.0) melalui Commons Wikimedia