Perbedaan Utama – DNA Polimerase 1 vs 3
DNA polimerase 1 dan 3 adalah dua jenis DNA polimerase yang terlibat dalam DNA prokariotik replikasi . DNA polimerase membantu sintesis untai DNA baru dengan merakit nukleotida ke untai induk. Baik DNA polimerase 1 dan 3 memiliki aktivitas replikatif dalam arah 5′ hingga 3′. DNA polimerase 1 memiliki aktivitas eksonuklease 5′ hingga 3′ dan 3′ hingga 5′. Namun, DNA polimerase 3 hanya memiliki aktivitas eksonuklease 3′ sampai 5′. Perbedaan yang menonjol antara DNA polimerase 1 dan 3 adalah DNA polimerase 1 terlibat dalam penghilangan primer dari fragmen dan mengganti celah dengan nukleotida yang relevan sedangkan DNA polimerase 3 terutama terlibat dalam sintesis untai utama dan tertinggal .
Topik bahasan kami tentang:
- Apa itu DNA Polimerase 1 – Pengertian, Struktur, Fungsi 2. Apa itu DNA Polymerase 3 – Pengertian, Struktur, Fungsi 3. Apa Persamaan Antara DNA Polimerase 1 dan 3 – Garis Besar Karakteristik Umum 4. Apa Perbedaan Antara DNA Polimerase 1 dan 3 – Perbandingan Perbedaan Kunci
Istilah Kunci: DNA Polimerase 1, DNA Polimerase 3, Aktivitas Exonuclease 3′ Sampai 5′, Aktivitas Exonuclease 5′ Sampai 3′, Pengisian Celah, Fragmen Klenow, Polimerisasi, Proofreading, Replikasi DNA Prokariotik
Yang perlu anda ketahui tentang DNA Polimerase 1
DNA polimerase 1 merupakan salah satu jenis DNA polimerase yang memiliki aktivitas polimerisasi, aktivitas proofreading, dan aktivitas penyisihan primer. DNA polimerase 1 pertama kali ditemukan oleh Arthur Kornberg pada tahun 1956. Ia dianugerahi Hadiah Nobel untuk penemuan ini pada tahun 1959. DNA polimerase 1 dikodekan oleh gen polA . Ukuran gen polA adalah 3000 bp. DNA polimerase 1 terlibat dalam replikasi DNA prokariotik karena membantu sintesis untai DNA baru dalam arah 5′ ke 3′. Selain itu, DNA polimerase 1 terlibat dalam mengisi celah, perbaikan, dan rekombinasi . Enzim, DNA polimerase 1 mengisi celah pada DNA untai ganda, yang penting dalam perbaikan DNA. DNA polimerase 1 memiliki aktivitas eksonuklease 3′ hingga 5′ dan aktivitas eksonuklease 5′ hingga 3′. Aktivitas eksonuklease 5′ ke 3′ mendegradasi DNA untai tunggal dan ganda dalam arah 5′ ke 3′. Setelah aktivitas eksonuklease 5′ hingga 3′ dihilangkan dari holoenzim DNA polimerase 1, molekul yang tersisa disebut fragmen Klenow .
Gambar 1: Domain fungsional DNA polimerase 1
Fragmen Klenow adalah molekul yang berguna dalam reaksi amplifikasi DNA. Hal ini penting dalam perbaikan ketidakcocokan . Tiga domain fungsional DNA polimerase 1 ditunjukkan pada gambar 1.
Yang perlu anda ketahui tentang DNA Polimerase 3
DNA polimerase 3 adalah enzim utama yang terlibat dalam replikasi DNA prokariotik. DNA polimerase 3 memiliki aktivitas polimerisasi 5′ hingga 3′ di mana nukleotida baru ditambahkan ke rantai yang sedang tumbuh pada ujung 3’nya. Enzim membantu pasangan basa nukleotida yang masuk dengan untai cetakan. Fungsi lain dari DNA polimerase 3 adalah mengoreksi DNA yang direplikasi. DNA polimerase 3 memiliki aktivitas eksonuklease 3 ‘sampai 5’. Maka dari itu, enzim ini membaca nukleotida yang baru ditambahkan, dan jika ada ketidakcocokan dengan untai cetakan, nukleotida tersebut akan dibuang dan disintesis ulang. Maka dari itu, DNA polimerase 3 penting dalam menjaga stabilitas genom.
Gambar 2: DNA polimerase 3
Holoenzim DNA polimerase 3 terdiri dari sepuluh subunit, yang disusun menjadi dua DNA polimerase. Subunit adalah subunit katalitik. Subunit memiliki aktivitas proofreading 3′ hingga 5′. Subunit memiliki fungsi yang tidak diketahui. Subunit dikodekan oleh gen dnaE. Subunit dan dikodekan oleh gen dnaQ dan holE. Struktur DNA polimerase 3 ditunjukkan pada gambar 2.
Persamaan Antara DNA Polimerase 1 dan 3
- DNA polimerase 1 dan DNA polimerase 3 adalah dua keluarga DNA polimerase.
- Baik DNA polimerase 1 dan DNA polimerase 3 terlibat dalam replikasi DNA prokariotik.
- Baik DNA polimerase 1 dan DNA polimerase 3 memiliki aktivitas polimerase dan juga aktivitas eksonuklease.
- Kedua DNA polimerase melakukan replikasi DNA secara semi-konservatif
Perbedaan Antara DNA Polimerase 1 dan 3
Definisi
DNA Polimerase 1: DNA polimerase 1 adalah DNA polimerase yang dikodekan oleh gen polA dan terlibat dalam replikasi DNA prokariotik.
DNA Polimerase 3: DNA polimerase 3 adalah enzim utama yang membantu replikasi DNA prokariotik.
Penemuan
DNA Polimerase 1: DNA polimerase 1 pertama kali ditemukan oleh Arthur Kornberg pada tahun 1956.
DNA Polymerase 3: DNA polymerase 3 pertama kali ditemukan oleh Thomas Kornberg dan Malcolm Gefer pada tahun 1970.
Dikodekan oleh
DNA Polimerase 1: DNA polimerase 1 dikodekan oleh gen poliA .
DNA Polimerase 3: DNA polimerase 3 dikodekan oleh gen dnaE, dnaQ, dan holE.
Keluarga
DNA Polimerase 1: DNA polimerase 1 milik keluarga DNA polimerase A.
DNA Polimerase 3: DNA polimerase 3 milik keluarga DNA polimerase C.
Aktivitas Eksonuklease
DNA Polimerase 1: DNA polimerase 1 memiliki aktivitas eksonuklease 3′ hingga 5′ dan aktivitas eksonuklease 5′ hingga 3′.
DNA Polimerase 3: DNA polimerase 3 hanya memiliki aktivitas eksonuklease 3′ sampai 5′.
Fungsi
DNA Polimerase 1: DNA polimerase 1 menghilangkan primer RNA dari arah 5′ ke 3′.
DNA Polimerase 3: DNA polimerase 3 menambahkan asam deoksiribonukleat ke ujung 3′.
RNA Primer
DNA Polimerase 1: DNA polimerase 1 menghilangkan primer RNA.
DNA Polimerase 3: DNA polimerase 3 membutuhkan primer RNA untuk mensintesis DNA.
Sintesis DNA
DNA Polimerase 1: DNA polimerase 1 menambahkan nukleotida ke rantai polinukleotida yang sedang tumbuh.
DNA Polimerase 3: DNA polimerase 3 adalah enzim kunci untuk mensintesis DNA pada prokariota.
Untaian Tertinggal/Terdepan
DNA Polimerase 1: DNA polimerase 1 hanya bekerja pada untai tertinggal.
DNA Polimerase 3: DNA polimerase 3 bekerja pada untai terdepan dan tertinggal dari garpu replikasi.
Tingkat Sintesis DNA
DNA Polimerase 1: DNA polimerase 1 dapat menambahkan 10 hingga 20 nukleotida per detik.
DNA Polimerase 3: DNA polimerase 3 dapat menambahkan sekitar 1000 nukleotida per detik.
Kata terakhir
DNA polimerase 1 dan 3 adalah dua jenis DNA polimerase yang terlibat dalam replikasi DNA prokariotik. Kedua jenis DNA polimerase memiliki aktivitas polimerisasi 5 ‘sampai 3’. Selain itu, kedua enzim memiliki aktivitas eksonuklease 3 ‘sampai 5′ untuk proofreading. Fungsi utama DNA polimerase 3 adalah fungsinya dalam polimerisasi. Namun, DNA polimerase 1 memiliki aktivitas eksonuklease 5′ sampai 3’. Dengan aktivitas eksonuklease 5′ hingga 3′, DNA polimerase 1 mampu menghilangkan primer. Celah pembentuk juga diisi oleh DNA polimerase 1. Maka dari itu, Perbedaan yang menonjol antara DNA polimerase 1 dan 3 adalah perannya dalam replikasi DNA prokariotik.
Sumber bacaan:
- “DNA Polimerase I.” Manual Enzim Worthington. Np, dan Web. Tersedia di sini . 09 Agustus 2017. 2. Marians, Kenneth J., Hiroshi Hiasa, dan Deok Ryong Kim. “Peran Subunit Inti DNA Polimerase III di Garpu Replikasi ADALAH SATU-SATUNYA SUBUNIT YANG DIBUTUHKAN UNTUK REPLIKASI PROSESIF.” Jurnal Kimia Biologi. Np, 23 Januari 1998. Web. Tersedia di sini . 09 Agustus 2017.
Sumber gambar:
- “Domain Polimerase” Oleh (tidak diketahui) “Molekul Bulan Ini”, Maret 2000 – Bank Data Protein (Domain Publik) melalui Commons Wikimedia 2. “DNA polimerase III (dengan subunit)” Oleh Alepopoli – Karya sendiri (CC BY-SA 3.0) melalui Commons Wikimedia
