Perbedaan Utama – Ti vs Ri Plasmid
Agrobacterium merupakan patogen tanaman yang menginduksi berbagai penyakit pada tanaman tingkat tinggi. Plasmid Ti (penginduksi tumor) dan Ri (penginduksi akar) adalah dua jenis plasmid alami yang diproduksi oleh spesies Agrobacterium . Plasmid Ti diproduksi oleh Agrobacterium tumefaciens sedangkan plasmid Ri diproduksi oleh Agrobacterium rhizogenes. Plasmid Ti dan Ri terdiri dari bagian DNA plasmid yang dikenal sebagai T-DNA yang ditransfer ke dalam genom tanaman dengan bantuan gen virulensi (vir). Perbedaan yang menonjol antara Ti dan Ri plasmid adalah Ti Plasmid menginduksi tumor/mahkota empedu di dikotil sedangkan Ri plasmid menginduksi akar berbulu . Karena kemampuannya menginfeksi tanaman, baik plasmid Ti maupun Ri banyak digunakan sebagai vektor untuk menghasilkan tanaman transgenik.
Topik bahasan kami tentang:
- Apa itu Plasmid Ti – Pengertian, Struktur, Produksi Vektor 2. Apa Itu Plasmid Ri – Pengertian, Struktur, Pembentukan Vektor 3. Apa Persamaan Antara Ti dan Plasmid Ri – Garis Besar Ciri-ciri Umum 4. Apa Perbedaan Antara Ti dan Ri Plasmid – Perbandingan Perbedaan Kunci
Kata Kunci: Spesies Agrobacterium, Rekayasa Genetika, Akar Berbulu, Ri Plasmid ( pRi ), T-DNA, Ti Plasmid ( pTi ), Tumor, Gen vir
Yang perlu anda ketahui tentang Ti Plasmid?
Ti plasmid adalah istilah untuk jenis plasmid yang memungkinkan Agrobacterium tumefaciens menginfeksi tanaman, menghasilkan tumor/tumor empedu mahkota. Dengan demikian, plasmid Ti terdiri dari gen pembentuk tumor dan gen virulensi ( vir ). Gen vir bertanggung jawab untuk transfer T-DNA yang mengandung gen pembentuk tumor ke dalam genom tanaman melalui eksisi dan integrasi. Sebuah plasmid Ti khas terdiri dari empat wilayah: wilayah A (T-DNA bertanggung jawab untuk pembentukan tumor), wilayah B (bertanggung jawab untuk replikasi), wilayah C (bertanggung jawab untuk konjugasi), dan wilayah D (bertanggung jawab untuk virulensi). Gen di wilayah T-DNA mengontrol produksi hormon pertumbuhan tanaman (auxin dan agropine), menginduksi proliferasi sel tanaman yang terinfeksi . Kedua ujung wilayah T-DNA diapit oleh urutan perbatasan yang berisi pengulangan urutan langsung dari 24 pasangan basa. Hanya batas kanan yang sangat diperlukan untuk transfer T-DNA. Struktur plasmid Ti ditunjukkan pada Gambar 1.
Gambar 1: Ti Plasmid
Dalam transformasi gen yang dimediasi Agrobacterium , vektor dirancang berdasarkan Ti-Plasmid. Vektor terdiri dari urutan perbatasan T-DNA, gen vir , dan wilayah T-DNA yang dimodifikasi. Selama modifikasi daerah T-DNA, gen yang bertanggung jawab untuk pembentukan tumor dihilangkan dan digantikan oleh gen asing yang akan diubah.
Yang perlu anda ketahui tentang Ri Plasmid?
Ri plasmid adalah istilah untuk jenis plasmid yang memungkinkan Agrobacterium rhizogenes menginfeksi sel celana dengan menghasilkan akar berbulu. Ini terdiri dari dua fragmen T-DNA yang dikenal sebagai Tr-DNA dan T1-DNA. Kedua fragmen dipisahkan oleh segmen DNA 15 kb. Tr-DNA mirip dengan daerah T-DNA dari plasmid Ti dan mengandung gen yang menginduksi produksi hormon pertumbuhan. Wilayah T1-DNA terdiri dari empat gen: rolA (bertanggung jawab untuk pembentukan akar berbulu), rolB (menginduksi inisiasi akar dan pembentukan kalus), rolC (mempromosikan pertumbuhan akar), dan rolD (menekan pertumbuhan kalus). Transformasi T-DNA diinduksi oleh gen vir . Pembentukan akar berbulu oleh Agrobacterium rhizogenes ditunjukkan pada gambar 2.
Gambar 2: Akar Berbulu
Plasmid Ti sebagian besar digantikan oleh plasmid Ri dalam rekayasa genetika.
Persamaan Antara Ti dan Ri Plasmid
- Plasmid Ti dan Ri diproduksi secara alami oleh Agrobacterium.
- Kedua jenis plasmid menyebabkan penyakit pada banyak tanaman dikotil.
- Baik plasmid Ti dan Ri mentransfer sebagian DNA plasmid yang dikenal sebagai DNA T ke dalam genom tanaman dengan bantuan gen virulensi (vir).
- Ukuran plasmid Ti dan Ri adalah sekitar 200 kb.
- Urutan pengaturan beberapa gen yang ditemukan dalam DNA T dari kedua plasmid dikenali oleh mekanisme seluler tanaman.
- Gen lain dalam DNA T terdiri dari urutan pengatur prokariotik.
- Karena kemampuannya menginfeksi sel tanaman, plasmid Ti dan Ri digunakan dalam rekayasa genetika untuk menghasilkan tanaman transgenik.
Perbedaan Antara Ti dan Ri Plasmid
Definisi
Ti Plasmid: Ti plasmid adalah jenis plasmid yang memungkinkan bakteri menginfeksi tanaman, menghasilkan tumor / tumor mahkota empedu.
Ri Plasmid: Ri plasmid adalah jenis plasmid yang memungkinkan bakteri menginfeksi sel tanaman dengan menghasilkan akar berbulu.
Jenis spesies Agrobacterium
Ti Plasmid: Ti plasmid diproduksi oleh Agrobacterium tumefaciens.
Ri Plasmid: Ri plasmid diproduksi oleh Agrobacterium rhizogenes.
Ukuran
Ti Plasmid: Ukuran plasmid Ti adalah 180-205 kb.
Ri Plasmid: Ukuran plasmid Ri adalah 250 kb.
Jenis Penyakit
Ti Plasmid: Ti plasmid menginduksi pembentukan mahkota empedu/tumor.
Ri Plasmid: Ri plasmid menginduksi pembentukan akar berbulu.
Jenis Studi
Ti Plasmid: Ti plasmid kurang dipelajari dibandingkan dengan Ri plasmid.
Ri Plasmid: Ri plasmid dipelajari dengan baik.
Kata terakhir
Plasmid Ti dan Plasmid Ri adalah dua jenis plasmid yang ditemukan pada spesies Agrobacterium yang berbeda. Baik plasmid Ti dan plasmid Ri terdiri dari T-DNA dan gen vir . Plasmid Ti dapat ditemukan pada Agrobacterium tumefaciens yang menginduksi pembentukan tumor mahkota empedu. Plasmid Ri dapat ditemukan pada Agrobacterium rhizogenes yang menginduksi pembentukan akar berbulu. Perbedaan yang menonjol antara plasmid Ti dan Ri adalah jenis penyakit yang disebabkan oleh masing-masing jenis plasmid.
Sumber bacaan:
- “Kuliah 26: Ti dan Ri Plasmid.” NPTEL, IIT Guwahati, Tersedia di sini . 2.Haneef, Deena T Kochunni Jazir. “Agrobacterium rhizhogenes dan Ri Plasmid.” Tersedia di sini .
Sumber gambar:
- “Ti plasmid” Oleh Mouagip – Karya sendiri (CC0) melalui Commons Wikimedia 2. “Agrobacterium rhizogenes” Oleh FruitDefendu – Karya sendiri (CC BY-SA 3.0) melalui Commons Wikimedia
