Enzim adalah molekul protein yang dapat bertindak sebagai katalis biologis. Enzim memiliki tiga karakteristik karakteristik. Pertama, fungsi utama enzim adalah meningkatkan laju reaksi. Kedua, satu enzim tertentu bekerja secara spesifik pada satu substrat tertentu, menghasilkan suatu produk. Dan ketiga, enzim dapat diatur dari aktivitas rendah ke aktivitas tinggi dan sebaliknya. Beberapa enzim mampu mengkatalisis reaksi yang sama. Mereka disebut isozim. Satu set unik sekitar 3.000 enzim diprogram secara genetik untuk disintesis, memberikan individualitas pada sel. Jika satu enzim menjadi rusak, efeknya akan menjadi bencana. Nama umum, serta nama sistematis, digunakan dalam penamaan enzim.
Artikel ini menjelaskan,
- Bagaimana Penamaan Enzim 2. Prinsip Penamaan Enzim 3. Tingkat Klasifikasi Enzim
Bagaimana Enzim Dinamakan
Nama-nama umum enzim umumnya mengandung awalan baik yang menggambarkan nama substrat, efek enzim atau reaksi kimia yang dikatalisisnya. Awalan diikuti oleh akhiran ‘ase’. Akhiran ini hanya menunjukkan identifikasi bahwa senyawa tersebut adalah enzim. Sebagai contoh, enzim yang memecah protein menjadi asam amino disebut sebagai ‘proteinase’ atau ‘protease’. Demikian juga, enzim yang terlibat dalam dehidrasi alkohol bernama ‘alkohol dehidrogenase’. Namun, ketika menamai beberapa enzim yang awalnya dipelajari seperti renin, pepsin, dan tripsin, nama-nama sepele yang lebih tua digunakan. Enzim glukosidase ditunjukkan pada gambar 1 . Ini mengkatalisis konversi maltosa menjadi dua molekul glukosa .
Gambar 1: Enzim glukosidase
Tatanama sistematis dan klasifikasi enzim berdasarkan reaksi yang dikatalisisnya dikembangkan oleh International Union of Biochemistry and Molecular Biology (IUBMB). Baik nomenklatur dan klasifikasi enzim berhubungan bersama karena saling ketergantungan yang erat.
Prinsip Penamaan Enzim
Tiga prinsip umum dalam nomenklatur enzim adalah,
- Akhiran -ase hanya boleh digunakan untuk entitas katalitik tunggal. Maka dari itu, tidak dapat diterapkan pada sistem yang mengandung lebih dari satu enzim. 2. Prinsip klasifikasi dan tata nama harus didasarkan pada reaksi yang dikatalisis oleh enzim tertentu.3. Enzim dibagi menjadi beberapa kelompok, tergantung pada reaksi yang dikatalisis.
Kelompok-kelompok enzim yang terkait secara fungsional diklasifikasikan dengan menetapkan nomor kode untuk setiap kelompok. Nomor kode diawali dengan ‘EC’ bersama dengan empat unsur yang dipisahkan oleh titik. Keempat unsur tersebut mengandung arti sebagai berikut:
- Gambar pertama menunjukkan kelas enzim.
- Gambar kedua menunjukkan subkelas enzim.
- Gambar keempat menunjukkan sub-subkelas enzim.
- Angka kelima menunjukkan nomor seri enzim dalam sub-subkelasnya.
Klasifikasi Enzim
Klasifikasi enzim tingkat atas, nama dan fungsinya ditunjukkan pada tabel di bawah ini.
|
Kelas Enzim |
Nama dan Fungsi |
|
EC 1 |
Oksidoreduktase : Penambahan atau penghilangan air |
|
EC 2 |
Transferase: Transfer elektron |
|
EC 3 |
Hidrolase: Transfer radikal |
|
EC 4 |
Liase: Memisahkan atau membentuk ikatan CC |
|
EC 5 |
Isomerase: Mengubah geometri atau struktur molekul |
|
EC 6 |
Ligase: Penggabungan dua molekul melalui hidrolisis ikatan fosfat dalam ATP atau trifosfat lainnya. |
Tabel 1: Klasifikasi enzim tingkat atas
Suatu enzim dapat ditentukan secara lengkap dengan nomenklatur ini. Sebagai contoh, heksokinase adalah transferase (EC 2), menambahkan gugus fosfat (EC 2.7) ke gula heksosa yang mengandung gugus alkohol (EC 2.7.1). Maka dari itu, nomenklatur heksokinase adalah EC 2.7.1.1.
Kata terakhir
Enzim meningkatkan laju reaksi dengan mengkatalisisnya. Mereka biasanya diberi nama berdasarkan substrat yang mereka gunakan. Enzim juga dinamai berdasarkan jenis reaksi yang dikatalisisnya. Sebuah tata nama sistematis, menggabungkan dengan klasifikasi enzim dikembangkan oleh IUBMB. Enzim dikembangkan menjadi enam kelas dengan tata nama enzim yang sistematis.
Referensi: 1. “Nomenklatur Enzim.” Nomenklatur Biokimia IUBMB. Np, dan Web. 20 Mei 2017. <http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/>. 2. “Klasifikasi dan Nomenklatur Enzim berdasarkan Reaksi yang Dikataliskannya.” Klasifikasi Enzim. Np, dan Web. 20 Mei 2017. <http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/rules.html>. 3. “Peran Enzim dalam Reaksi Biokimia.” Enzim. Np, dan Web. 20 Mei 2017. <http://chemistry.elmhurst.edu/vchembook/570enzymes.html>. 4. “Pengantar Enzim.” Penamaan dan Klasifikasi (Pengantar Enzim). Np, dan Web. 20 Mei 2017. <http://www.worthington-biochem.com/introbiochem/naming.html>.
Gambar Courtesy: 1. “Enzim Glucosidase” Oleh Thomas Shafee – Pekerjaan sendiri (CC BY-SA 4.0) melalui Commons Wikimedia
