Peta plasmid adalah posisi relatif unsur-unsur di dalam plasmid . Peta plasmid dapat dibaca dengan memahami ciri-ciri plasmid. Mereka adalah nama dan ukuran plasmid, unsur-unsur plasmid, posisi relatifnya, dan orientasi promotor. Asal usul replikasi (ORI), gen resistensi antibiotik, situs kloning ganda (MCS), sisipan atau gen yang diinginkan, wilayah promotor, penanda yang dapat dipilih, dan situs pengikatan primer adalah unsur dari plasmid. Posisi relatif unsur-unsur dalam plasmid dapat ditentukan dengan memetakan plasmid. Proses yang terlibat dalam pemetaan plasmid disebut pemetaan restriksi.
Topik bahasan kami tentang:
- Apa itu Peta Plasmid – Pengertian, Pembatasan Pemetaan 2. Cara Membaca Peta Plasmid – Karakteristik-Karakteristik Peta Plasmid
Istilah Kunci: Unsur, Nama dan Ukuran Plasmid, Orientasi Promotor, Peta Plasmid, Enzim Pembatasan, Pemetaan Pembatasan
Yang perlu anda ketahui tentang Peta Plasmid?
Peta plasmid adalah representasi grafis dari plasmid, yang menunjukkan lokasi landmark utama atau unsur plasmid. Posisi relatif unsur-unsur dalam plasmid dapat diidentifikasi dengan pemetaan restriksi . Peta restriksi adalah peta situs pengenalan restriksi dalam plasmid tertentu. Maka dari itu, ia terlibat dalam pencernaan plasmid oleh enzim restriksi . Sebuah peta pembatasan ditunjukkan pada gambar 1 .
Gambar 1: Peta Pembatasan
Dua metode dapat digunakan dalam pemetaan pembatasan:
- Pembatasan Pencernaan
– Restriksi pencernaan plasmid dengan satu atau dua enzim restriksi
– Memetakan plasmid berdasarkan ukuran fragmen hasil plasmid
- Urutan
– Mengurutkan seluruh plasmid
– Identifikasi unsur-unsur plasmid
Cara Membaca Peta Plasmid
Gambar 2: Peta Plasmid
Pembacaan peta plasmid terutama berfokus pada karakteristik plasmid. Mereka;
- Nama dan ukuran plasmid
- Nama dan ukuran plasmid ditunjukkan di tengah lingkaran plasmid.
- Unsur-unsur plasmid –
- Asal replikasi – urutan DNA yang terlibat dalam inisiasi replikasi dengan merekrut mesin transkripsi bakteri.
- Gen resistensi antibiotik – memungkinkan pemilihan bakteri yang mengandung plasmid dalam media selektif.
- Situs kloning ganda – urutan pendek yang terdiri dari beberapa situs pengenalan restriksi untuk penyisipan fragmen DNA asing
- Sisipkan – gen yang diinginkan dimasukkan ke dalam plasmid
- Daerah promotor – tempat pengikatan RNA polimerase selama transkripsi
- Penanda yang dapat dipilih – memungkinkan pemilihan ekspresi yang berhasil dari gen yang disisipkan
- Situs pengikatan primer – berfungsi sebagai situs inisiasi untuk amplifikasi PCR dari plasmid untuk pengurutan
- Posisi relatif unsur-unsur dalam plasmid
- Posisi relatif unsur plasmid dipetakan dengan pemetaan restriksi atau pengurutan.
- Orientasi promotor
- Orientasi promotor di dalam plasmid penting dalam menentukan orientasi semua unsur plasmid lainnya, terutama orientasi gen yang disisipkan. Transkripsi dimulai pada ujung 3′ promotor. Maka dari itu, gen harus berada dalam orientasi yang tepat agar dapat diekspresikan.
Kata terakhir
Peta plasmid dapat dibaca dengan memahami ciri-ciri peta plasmid seperti nama dan ukuran plasmid, jenis unsur dalam plasmid dan posisi relatifnya, serta orientasi promotor.
Sumber bacaan:
- “Apa Itu Plasmid?” Addgene , Tersedia di sini .
Sumber gambar:
- “Peta PDONR221” Oleh Tidak Ada yang Serius – Analisis Urutan: pDONR221. Addgen. Diperoleh pada 24 Januari 2016 (CC0) melalui Commons Wikimedia 2. “vektor kloning PGEX-3X’ Oleh Magnus Manske – Dibuat oleh Magnus Manske (CC BY-SA 3.0) melalui Commons Wikimedia
