Perbedaan yang menonjol antara isolasi DNA genom dan DNA plasmid adalah isolasi DNA genom menggunakan lisis yang kuat termasuk pemecahan enzimatik atau mekanis membran sel untuk melepaskan DNA genom ke dalam larutan, sedangkan isolasi DNA plasmid menggunakan lisis basa ringan untuk memasukkan DNA plasmid ke dalam larutan. solusi bersama dengan DNA genom. Selanjutnya, dalam isolasi DNA genom, setelah lisis sel, DNA genom dapat dimurnikan dari membran lipid dan protein sedangkan pada isolasi DNA plasmid, netralisasi dengan kalium asetat akan memisahkan DNA plasmid dari DNA genom.
Isolasi DNA genom dan DNA plasmid adalah dua metode ekstraksi yang penting untuk isolasi DNA untuk digunakan dalam berbagai teknik dalam bioteknologi.
Topik bahasan kami tentang:
- Apa itu Isolasi DNA Genom – Pengertian, Proses, Kepentingan 2. Apa Itu Isolasi DNA Plasmid – Pengertian, Proses, Kepentingan 3. Apa Persamaan Antara DNA Genom dan Isolasi DNA Plasmid – Garis Besar Ciri-ciri Umum 4. Apa Perbedaannya Antara DNA Genom dan Isolasi DNA Plasmid – Perbandingan Perbedaan Utama
Istilah Utama
Lisis Sel, Isolasi DNA Genom, Isolasi DNA Plasmid
Yang perlu anda ketahui tentang Isolasi DNA Genom
Isolasi DNA genom adalah prosedur ekstraksi DNA genom dari sel. Salah satu karakteristik utama dari isolasi DNA genom adalah membutuhkan langkah lisis yang kuat untuk melepaskan DNA genom ke dalam larutan. Umumnya, dinding sel dapat dipecah secara enzimatik oleh lisozim dan proteinase K. Sebaliknya, pemecahan mekanis dinding sel adalah proses yang lebih universal yang dilakukan dengan pemukulan manik-manik pada pusaran. Setelah lisis sel, pemurnian DNA baik dengan ekstraksi fenol-kloroform atau metode lain sangat penting untuk membersihkan bilayer lipid, protein, dan puing-puing sel lainnya.
Gambar 1: Isolasi DNA genom
Selanjutnya, degradasi DNA genom adalah salah satu kelemahan utama yang terjadi selama isolasi DNA genom. Maka dari itu, penting untuk menjaga suhu rendah atau menggunakan inhibitor kimia untuk mencegah aktivitas DNase sekaligus mencegah kerusakan kromosom selama ekstraksi.
Yang perlu anda ketahui tentang Isolasi DNA Plasmid?
Isolasi DNA plasmid adalah proses ekstraksi DNA plasmid dari sel. Itu juga membuat DNA plasmid keluar dari DNA genom sel-sel ini. Namun, salah satu poin kunci dari isolasi DNA plasmid adalah melakukan prosedur lisis sel ringan seperti lisis basa. Pada dasarnya, buffer lisis basa mengandung natrium hidroksida dan SDS, yang sepenuhnya mendenaturasi DNA plasmid dan DNA genom. Namun, sangat penting untuk mencegah denaturasi yang berlebihan, yang dapat mendenaturasi DNA plasmid secara ireversibel.
Gambar 2: Isolasi DNA Plasmid
Langkah yang mengikuti lisis sel adalah netralisasi dalam isolasi DNA plasmid. Umumnya, kalium asetat adalah reagen untuk netralisasi. Karena ukuran DNA plasmid yang kecil dibandingkan dengan DNA genom, DNA plasmid mudah mengalami renaturasi sedangkan DNA genom cenderung kusut. Setelah itu, sentrifugasi dapat membentuk pelet yang mengandung DNA genom yang terikat pada protein. Maka dari itu, DNA plasmid tetap berada di supernatan. Pada akhirnya, DNA plasmid ini dapat diendapkan dengan etanol.
Persamaan Antara DNA Genom dan Isolasi DNA Plasmid
- Ini adalah dua metode ekstraksi DNA yang digunakan dalam bioteknologi.
- Dua langkah utama dari kedua jenis isolasi DNA adalah lisis sel dan pemurnian DNA.
Perbedaan Antara DNA Genom dan Isolasi DNA Plasmid
Definisi
Isolasi DNA genom adalah istilah untuk teknik yang digunakan untuk mengisolasi DNA dalam sampel biologis, sedangkan isolasi DNA plasmid adalah istilah untuk isolasi DNA plasmid dari sampel biologis.
sampel
DNA genom dapat diisolasi dari sampel biologis yang berbeda, sedangkan isolasi DNA plasmid terutama dari kultur sel bakteri atau jamur.
Lisis sel
Selain itu, lisis sel adalah Perbedaan yang menonjol antara DNA genom dan isolasi DNA plasmid. Isolasi DNA genom menggunakan lisis yang kuat termasuk pemecahan enzimatik atau mekanis dari membran sel untuk melepaskan DNA genom ke dalam larutan sementara isolasi DNA plasmid menggunakan lisis basa ringan untuk memasukkan DNA plasmid ke dalam larutan bersama dengan DNA genom.
Denaturasi
Selanjutnya, pH buffer lisis sel untuk isolasi DNA genom adalah 7-9, yang tidak mendenaturasi DNA sedangkan pH buffer lisis sel isolasi DNA plasmid adalah 12,1-12,3, yang mendenaturasi DNA plasmid dan DNA genom.
Tahap kedua
Selain itu, setelah lisis sel, DNA genom dapat dimurnikan dari membran lipid dan protein sedangkan dalam isolasi DNA plasmid, langkah kedua adalah menetralkan dengan kalium asetat untuk memisahkan DNA plasmid dari DNA genom.
Selama Sentrifugasi
Selama sentrifugasi, DNA genom muncul di pelet sementara DNA plasmid muncul di supernatan.
Makna
Juga, isolasi DNA genom adalah metode yang cukup mudah, sedangkan isolasi DNA plasmid adalah metode yang lebih sensitif.
Aplikasi Hilir
Aplikasi hilir isolasi DNA genom dapat berupa PCR atau sekuensing, sedangkan aplikasi hilir isolasi DNA plasmid dapat berupa kloning transfeksi atau terapi gen.
Kata terakhir
Isolasi DNA genom adalah metode ekstraksi DNA dari berbagai jenis sampel biologis. Umumnya, ini adalah metode yang lebih mudah, yang melibatkan pemecahan keras membran sel diikuti oleh pemurnian DNA genomik dari bilayer lipid, protein, dan puing-puing sel lainnya. Di sisi lain, isolasi DNA plasmid adalah metode yang lebih sensitif, yang menggunakan lisis basa ringan untuk memecahkan membran sel yang terbuka. Selain itu, mengandung langkah netralisasi untuk memisahkan DNA plasmid dari DNA genom. Akhirnya, DNA plasmid terjadi di supernatan. Maka dari itu, Perbedaan yang menonjol antara DNA genom dan isolasi DNA plasmid adalah metode lisis sel dan pemurnian DNA.
Sumber bacaan:
- Kennedy, Suzanne. “Ekstraksi DNA Plasmid vs. Genom: Perbedaannya.” Bitesize Bio, 20 Juni 2019, Tersedia Disini .
Sumber gambar:
- “Gambar 17 01 02″ Oleh CNX OpenStax ( CC BY 4.0 ) melalui Commons Wikimedia 2. ” Persiapan-plasmid-dna-oleh-mwaqas-noman-hafeez-khosa-6-638 ” Oleh Noman-Hafeez khosa ( CC BY-SA 4.0 ) melalui Commons Wikimedia
