Perbedaan Utama – Genomik vs Proteomik
Genomik, proteomik, dan metabolomik adalah bidang yang terlibat dalam studi dan klasifikasi makhluk hidup berdasarkan genomnya , produk protein yang disintesis berdasarkan instruksi genetik, dan jenis molekul yang dimetabolisme, masing-masing. Genomik dan proteomik adalah bidang yang terkait erat. Perbedaan yang menonjol antara genomik dan proteomik adalah genomik adalah studi tentang seluruh rangkaian gen dalam genom sel sedangkan proteomik adalah studi tentang seluruh rangkaian protein yang dihasilkan oleh sel . Metabolomik, di sisi lain, adalah studi tentang seluruh rangkaian senyawa dengan berat molekul rendah yang berfungsi sebagai substrat dan produk sampingan dari reaksi enzimatik sel.
Topik bahasan kami tentang:
- Apa itu Genomics – Definisi, Teknik, Klasifikasi 2. Apa itu Proteomik – Definisi, Teknik, Klasifikasi 3. Apa Persamaan Antara Genomik dan Proteomik – Garis Besar Karakteristik Umum 4. Apa Perbedaan Antara Genomik dan Proteomik – Perbandingan Perbedaan Kunci
Istilah Kunci: Gen, Genomik, Proyek Genom Manusia (HGP), Proyek Proteom Manusia (HPP), Protein, Proteom, Proteomik
Yang perlu anda ketahui tentang Genomik?
Genomics adalah istilah untuk studi tentang seluruh set gen dalam genom. Genom adalah kumpulan lengkap informasi genetik suatu organisme, terutama terdiri dari DNA. Teknik throughput tinggi digunakan dalam genomik untuk memetakan, mengurutkan, dan menganalisis genom. Teknik yang terlibat dalam genomik termasuk strategi sekuensing gen seperti sekuensing gen terarah, sekuensing senapan seluruh genom, konstruksi tag urutan terekspresikan (EST), identifikasi polimorfisme nukleotida tunggal (SNP), dan analisis dan interpretasi data sekuensing menggunakan perangkat lunak yang berbeda dan database. Langkah-langkah utama dari urutan senapan ditunjukkan pada gambar 1.
Gambar 1: Pengambilan Sampel Sekuensing Senapan Lingkungan (ESS) , (B) Partikel Penyaringan, (C) Ekstraksi dan Lisis DNA, (D) Kloning dan Pustaka, (D) Sekuensing, (E) Perakitan Urutan
Dua bidang utama genomik adalah genomik struktural dan genomik fungsional. Dalam genomik struktural , struktur dan posisi relatif gen dipelajari sementara dalam genomik fungsional , fungsi atau peran gen dalam mengatur aktivitas metabolisme dipelajari. Proyek Pengurutan Genom adalah perkembangan terbaru dalam genomik. Proyek Genom Manusia (HGP) selesai pada tahun 2003. Tujuan dari Proyek Genom Manusia adalah:
- Untuk mengidentifikasi semua (sekitar 20.000-25.000) gen dalam genom manusia,
- Untuk menentukan seluruh urutan (sekitar 3 miliar pasangan basa kimia) yang menyusun genom manusia,
- Untuk menyimpan informasi ini dalam database,
- Untuk meningkatkan alat untuk analisis data,
- Untuk mentransfer teknologi terkait ke sektor swasta, dan
- Untuk mengatasi masalah etika, hukum, dan sosial (ELSI) yang mungkin timbul dari proyek.
Selain genom manusia, genom tikus dan padi juga menjadi sasaran studi genomik.
Yang perlu anda ketahui tentang Proteomik?
Proteomik adalah istilah untuk studi tentang seluruh rangkaian protein yang diproduksi oleh sel. Proteom adalah set lengkap protein yang diproduksi oleh sel. Dalam proteomik, karakterisasi struktur 3D dan fungsi protein dilakukan dengan menggunakan metode throughput tinggi. Teknik yang terlibat dalam proteomik termasuk ekstraksi dan pemisahan elektroforesis protein, pencernaan protein dengan menggunakan tripsin menjadi fragmen kecil, penentuan urutan asam amino dengan spektrometri massa, dan identifikasi protein menggunakan informasi dalam database protein. Selain itu, struktur 3D protein dapat diprediksi menggunakan metode berbasis perangkat lunak. Ekspresi protein dapat dipelajari dengan mikroarray protein. Peta jaringan protein dapat dikembangkan untuk menentukan interaksi protein-protein. Berbagai fenomena proteomik ditunjukkan pada Gambar 2.
Gambar 2: Proteomik
Produk protein dari gen genom manusia dipelajari selama Proyek Proteome Manusia (HPP). Salah satu tujuan utama Proyek Proteome Manusia adalah untuk mengidentifikasi protein yang terlibat dalam penyakit utama.
Persamaan Antara Genomik dan Proteomik
- Genomik dan proteomik adalah dua bidang ilmiah yang terkait erat yang digunakan dalam studi organisme.
- Teknik throughput tinggi digunakan dalam genomik dan proteomik.
Perbedaan Antara Genomik dan Proteomik
Definisi
Genomik: Genomics adalah istilah untuk studi tentang seluruh set gen dalam genom.
Proteomik: Proteomik adalah istilah untuk studi tentang seluruh rangkaian protein yang diproduksi oleh sel.
fenomena
Genomics: Genomics melibatkan pemetaan, pengurutan, dan analisis genom.
Proteomik: Proteomik melibatkan struktur dan fungsi 3D protein, dan interaksi protein-protein.
Klasifikasi
Genomik: Dua jenis genomik adalah genomik struktural dan genomik fungsional.
Proteomik: Tiga jenis proteomik adalah proteomik struktural, fungsional, dan ekspresi.
Area Penting
Genomik: Proyek pengurutan genom seperti Proyek Genom Manusia adalah bidang penting genomik.
Proteomik: Pengembangan database proteome seperti SWISS-2DPAGE dan pengembangan perangkat lunak untuk desain obat berbantuan komputer adalah area penting dari proteomik.
Kata terakhir
Genomik dan proteomik adalah dua bidang ilmiah yang digunakan dalam studi organisme. Genomics adalah studi tentang seluruh set gen dalam suatu organisme sedangkan proteomik adalah studi tentang seluruh set protein yang diproduksi oleh sel. Perbedaan yang menonjol antara genomik dan proteomik adalah kriteria masing-masing bidang selama studi organisme.
Sumber bacaan:
- Griffiths, Anthony JF. “Genomics: gambaran umum.” Sebuah Pengantar Analisis Genetika. Edisi ke-7., Perpustakaan Kedokteran Nasional AS, 1 Januari 1970, Tersedia di sini . 2. Tanpa batas. “Genomik dan Proteomik.” Genomik dan Proteomik | Biologi Tanpa Batas, Tersedia di sini . 3. Graves, Paul R., dan Timothy AJ Haystead. “Panduan Ahli Biologi Molekuler untuk Proteomik.” Ulasan Mikrobiologi dan Biologi Molekuler, American Society for Microbiology, Maret 2002, Tersedia di sini .
Sumber gambar:
- “ Pengurutan senapan lingkungan” Oleh John C. Wooley, Adam Godzik, Iddo Friedberg – (CC BY 2.5) melalui Commons Wikimedia 2. “Proteomik” Oleh Xxl7441 di Wikibooks Bahasa Inggris – Ditransfer dari en.wikibooks ke Commons. (Domain Publik) melalui Commons Wikimedia
