Perbedaan yang menonjol antara plasmid yang dicerna tunggal dan plasmid yang dicerna ganda adalah enzim restriksi tunggal menghasilkan plasmid yang dicerna tunggal sedangkan dua jenis enzim restriksi yang berbeda menghasilkan plasmid yang dicerna ganda. Selanjutnya, penyisipan fragmen DNA asing dapat terjadi pada kedua orientasi dengan plasmid yang dicerna tunggal sedangkan penyisipan fragmen DNA asing hanya terjadi pada orientasi yang tepat dengan plasmid yang dicerna ganda.
Plasmid cerna tunggal dan plasmid cerna ganda adalah dua jenis plasmid yang digunakan dalam teknologi DNA rekombinan untuk menghasilkan DNA rekombinan.
Topik bahasan kami tentang:
- Apa itu Plasmid Pencernaan Tunggal – Definisi, Self-Ligasi, Orientasi 2. Apa itu Plasmid Pencernaan Ganda – Definisi, Pencernaan Ganda, Orientasi 3. Apa Persamaan Antara Plasmid Pencernaan Tunggal dan Plasmid Pencernaan Ganda – Garis Besar Karakteristik Umum 4. Apa Perbedaan Antara Plasmid Pencernaan Tunggal dan Plasmid Pencernaan Ganda – Perbandingan Perbedaan Kunci
Istilah Utama
Plasmid Pencernaan Ganda, Pencernaan Ganda, Orientasi, Plasmid Rekombinan, Plasmid Pencernaan Tunggal, Pencernaan Tunggal
Yang perlu anda ketahui tentang Plasmid Tercerna Tunggal?
Plasmid yang dicerna tunggal adalah jenis plasmid yang dicerna hanya dengan enzim restriksi tunggal. Maka dari itu, proses ini disebut pencernaan tunggal. Umumnya, plasmid yang digunakan dalam teknologi DNA rekombinan hanya berisi situs restriksi tunggal untuk enzim restriksi tertentu. Maka dari itu, pencernaan tunggal membuat plasmid sirkular menjadi linier, menghasilkan satu fragmen DNA. Kedua ujung fragmen DNA ini kompatibel satu sama lain; maka dari itu, mereka dapat menjalani self-ligation selama ligasi berikutnya dengan insert.
Gambar 1: Plasmid Tercerna Tunggal
Di sini, sisipan juga harus dicerna dengan enzim restriksi yang sama untuk menghasilkan ujung yang kompatibel dengan plasmid. Maka dari itu, ligasi terjadi dalam dua kemungkinan orientasi: pada orientasi 5′ hingga 3′ dan orientasi 3′ hingga 5′. Namun, sisipan dengan orientasi yang sama dengan daerah promotor dapat mengalami transkripsi. Dengan demikian, orientasi ini dikenal sebagai orientasi yang tepat. Sebelum melanjutkan, plasmid rekombinan dengan orientasi yang tepat harus dipilih dengan menyaring koloni yang ditransformasi, baik dengan PCR atau uji biokimia.
Yang perlu anda ketahui tentang Plasmid yang Dicerna Ganda?
Plasmid pencernaan ganda adalah plasmid yang mengalami pencernaan ganda dengan dua enzim restriksi. Di sini, reaksi ini dapat dilakukan dalam satu tabung. Situs restriksi untuk kedua pencernaan terjadi di dalam situs pengenalan restriksi dalam plasmid. Maka dari itu, reaksi pencernaan ganda juga menghasilkan fragmen DNA tunggal. Tapi, masing-masing dari kedua ujungnya diproduksi oleh enzim restriksi yang berbeda. Maka dari itu, ujung-ujung ini tidak kompatibel satu sama lain dan tidak mengalami self-ligation.
Gambar 2: Plasmid yang Dicerna Ganda
Yang terpenting, sisipan dapat diligasi dalam orientasi yang tepat dengan plasmid yang dicerna ganda dengan mencerna ujung sisipan untuk diligasi dalam orientasi yang tepat. Maka dari itu, plasmid yang dicerna ganda hanya menghasilkan plasmid rekombinan dengan orientasi yang tepat, yang membuat pemilihan orientasi selanjutnya tidak diperlukan. Ini menghemat waktu karena mengurangi langkah lengkap dari prosedur produksi DNA rekombinan.
Persamaan Antara Plasmid Pencernaan Tunggal dan Plasmid Pencernaan Ganda
- Plasmid pencernaan tunggal dan plasmid pencernaan ganda adalah dua jenis plasmid yang digunakan dalam teknologi DNA rekombinan.
- Pencernaan tunggal dan pencernaan ganda dapat dilakukan dengan reaksi satu langkah.
- Juga, pada keduanya, fragmen DNA asing disisipkan di antara kedua ujung plasmid yang dicerna.
- Selanjutnya, baik pencernaan tunggal dan ganda dari plasmid menghasilkan fragmen DNA tunggal sementara dua fragmen DNA terjadi ketika plasmid rekombinan dicerna.
Perbedaan Antara Plasmid Pencernaan Tunggal dan Plasmid Pencernaan Ganda
Definisi
Plasmid yang dicerna tunggal adalah istilah untuk plasmid yang dicerna oleh enzim restriksi tunggal sedangkan plasmid yang dicerna ganda adalah istilah untuk plasmid yang dicerna oleh dua enzim restriksi yang berbeda. Definisi ini menjelaskan Perbedaan yang menonjol antara plasmid yang dicerna tunggal dan plasmid yang dicerna ganda.
Berakhir
Dalam plasmid yang dicerna tunggal, pencernaan dengan enzim restriksi yang sama menghasilkan kedua ujungnya sementara, dalam plasmid yang dicerna ganda, pencernaan dengan enzim restriksi yang berbeda menghasilkan setiap ujungnya. Maka dari itu, ini adalah perbedaan utama yang penting antara plasmid yang dicerna tunggal dan plasmid yang dicerna ganda.
Ligasi sendiri
Lebih lanjut, self-ligation adalah perbedaan utama utama antara plasmid yang dicerna tunggal dan plasmid yang dicerna ganda. Ujung plasmid cerna tunggal kompatibel satu sama lain untuk self-ligation sedangkan ujung plasmid cerna ganda tidak kompatibel satu sama lain untuk self-ligation.
Pentingnya
Selain itu, penyisipan fragmen DNA asing dapat terjadi di kedua orientasi dalam plasmid yang dicerna tunggal sementara penyisipan fragmen DNA asing dapat dilakukan dalam orientasi yang tepat dalam plasmid yang dicerna ganda.
Jenis Plasmid Rekombinan
Plasmid yang dicerna tunggal dapat menghasilkan tiga jenis plasmid: dua plasmid rekombinan dengan orientasi berlawanan dan plasmid self-ligated tanpa sisipan. Sementara itu, plasmid tercerna ganda hanya dapat menghasilkan satu jenis plasmid rekombinan, yaitu dalam orientasi yang tepat. Jadi, ini adalah perbedaan utama lainnya antara plasmid yang dicerna tunggal dan plasmid yang dicerna ganda.
Hemat waktu
Fragmen rekombinan dari plasmid yang dicerna tunggal harus dipilih untuk orientasi yang tepat sementara plasmid yang dicerna ganda memastikan orientasi yang tepat dari fragmen DNA asing. Maka dari itu, plasmid yang dicerna ganda menghemat waktu dalam teknik DNA rekombinan, bukan plasmid yang dicerna tunggal.
Kata terakhir
Plasmid yang dicerna tunggal dicerna dengan enzim restriksi tunggal, yang menghasilkan ujung yang kompatibel dengan ligasi sendiri. Selain itu, ligasi mereka dengan fragmen DNA asing dapat terjadi di kedua orientasi. Maka dari itu, plasmid rekombinan dengan orientasi yang tepat harus dipilih. Di sisi lain, plasmid yang dicerna ganda dicerna dengan dua enzim restriksi yang berbeda. Maka dari itu, kedua ujungnya tidak cocok untuk self-ligation. Selain itu, fragmen DNA asing dapat diikat dalam orientasi yang tepat dengan plasmid yang dicerna ganda. Maka dari itu, Perbedaan yang menonjol antara plasmid yang dicerna tunggal dan plasmid yang dicerna ganda adalah jenis pencernaan dan orientasi sisipan.
Sumber bacaan:
- Griffiths AJF, Miller JH, Suzuki DT, dkk. Sebuah Pengantar Analisis Genetika. edisi ke-7. New York: WH Freeman; 2000. Membuat DNA rekombinan. Tersedia disini
