Perbedaan yang menonjol antara pembuatan profil DNA dan sekuensing DNA adalah pembuatan profil DNA adalah teknik forensik, yang memungkinkan identifikasi individu menurut susunan genetik mereka sedangkan sekuensing DNA adalah teknik dalam bioteknologi, menentukan urutan asam nukleat dari fragmen DNA tertentu. Selanjutnya, profil DNA mengambil bagian dalam analisis STR dengan PCR dan elektroforesis gel sedangkan sekuensing DNA mengambil bagian dalam penggabungan dideoksinukleotida berlabel oleh PCR dan penentuan urutan nukleotida dengan elektroforesis gel.
Profil DNA dan sekuensing DNA adalah dua teknik dalam biologi molekuler. Umumnya, mereka memberikan informasi tentang genom individu.
Topik bahasan kami tentang:
- Apa itu Profiling DNA – Pengertian, Prosedur, Kepentingan 2. Apa itu Sekuensing DNA – Pengertian, Prosedur, Kepentingan 3. Apa Persamaan Antara Profiling DNA dan Sekuensing DNA – Garis Besar Karakteristik Umum 4. Apa Perbedaan Antara Profiling DNA dan Sekuensing DNA – Perbandingan Perbedaan Kunci
Istilah Utama
Profil DNA, Urutan DNA, Identifikasi Forensik, Urutan Nukleotida, Pengujian Parentage, STR
Yang perlu anda ketahui tentang Profil DNA?
Profil DNA atau profil genetik adalah teknik forensik yang penting dalam identifikasi individu dan untuk pengujian keturunan. Secara signifikan, metode ini dikembangkan oleh Sir Alec Jeffreys bersama dengan Peter Gill dan Dave Werrett dari Forensic Science Service (FSS).
Gambar 1: Profil DNA
Umumnya, profil DNA memainkan peran kunci dalam perbandingan profil DNA tersangka kriminal. Juga, ini adalah proses sederhana, yang secara statistik lebih mudah karena otomatisasi.
Prosedur
Pemrofilan DNA berfokus pada penggunaan panel penanda STR multi-alel, yang secara struktural analog dengan minisatelit asli. Umumnya, STR jauh lebih pendek dibandingkan dengan minisatelit; biasanya, mereka adalah pengulangan dari empat basa. Maka dari itu, lebih mudah untuk memperkuatnya dengan PCR multipleks. Sementara itu, mereka dapat diperkuat dengan menggunakan primer urutan-spesifik. Selanjutnya, baik elektroforesis gel atau elektroforesis kapiler mengambil bagian dalam pemisahan fragmen yang dihasilkan.
Gambar 2: Profil DNA
Hebatnya, hingga 30 STR dapat dianalisis dalam satu injeksi elektroforesis kapiler. Sebagai contoh, STR adalah daerah yang sangat polimorfik. Namun, jumlah alel STR pada populasi manusia sangat sedikit. Biasanya, alel STR serupa terjadi sekitar 5-20% individu.
Yang perlu anda ketahui tentang Sekuensing DNA
Sekuensing DNA adalah teknik biologi molekuler yang penting untuk penentuan urutan basa nukleotida. Umumnya, metode pengurutan DNA yang lebih cepat pertama dikembangkan oleh Frederick Sanger pada tahun 1977. Juga, metode ini dikenal sebagai ‘pengurutan DNA dengan penghambat pemutus rantai’. Namun, metode pengurutan DNA lain dikembangkan oleh Walter Gilbert dan Allan Maxam pada tahun 1973. Sebagai contoh, metode ini dikenal sebagai ‘pengurutan DNA dengan degradasi kimia’. Biasanya, kedua metode diidentifikasi sebagai metode sekuensing DNA generasi pertama.
Gambar 3: Urutan DNA
Selain itu, metode pengurutan throughput tinggi yang disebut ‘Pengurutan generasi berikutnya’ atau ‘metode pengurutan generasi kedua dikembangkan pada pertengahan hingga akhir 1990-an. Secara signifikan, metode ini memungkinkan pengurutan ‘paralel masif’ melalui otomatisasi proses. Yang penting, mereka memungkinkan pengurutan seluruh genom sekaligus.
Prosedur
Biasanya, sekuensing Sanger membagi sampel DNA menjadi empat reaksi sekuensing terpisah, memungkinkan penambahan empat dideoksinukleotida (ddATP, ddCTP, ddGTP, dan ddTTP) ke dalam setiap campuran reaksi secara terpisah. Di sini, setiap dideoksinukleotida diberi label berfluoresensi (ddATP dengan pewarna hijau, ddCTP dengan pewarna biru, ddGTP dengan pewarna kuning, dan ddTTP dengan pewarna merah). Juga, konsentrasi mereka kira-kira 100 kali lipat lebih rendah daripada deoksinukleotida.
Gambar 4: Urutan Sanger
Pada dasarnya, setelah menjalani reaksi berantai polimerase, amplikon setelah denaturasi panas difraksinasi ukurannya pada gel poliakrilamida-urea yang mengalami denaturasi. Pada akhirnya, urutan nukleotida dapat ditentukan melalui visualisasi gel.
Persamaan Antara Profiling DNA dan Sekuensing DNA
- Profil DNA dan sekuensing DNA adalah dua teknik dalam biologi molekuler.
- Keduanya membantu mengungkap urutan nukleotida genom.
- Umumnya, mereka menggunakan PCR dan elektroforesis gel selama prosedur mereka.
- Demikian pula, kedua teknik memiliki banyak aplikasi dalam identifikasi forensik dan pengujian paternitas.
Perbedaan Antara Profiling DNA dan Sekuensing DNA
Definisi
Profil DNA adalah istilah untuk analisis pola unik dari sekuens DNA dalam genom untuk mengidentifikasi individu, sedangkan sekuensing DNA adalah istilah untuk penentuan sekuens nukleotida dari fragmen DNA.
Unsur Terfokus
Profil DNA berfokus pada pola STR dari lokus tertentu sementara sekuensing DNA berfokus pada urutan nukleotida dari fragmen DNA.
Tujuan PCR
PCR bertanggung jawab untuk amplifikasi daerah STR melalui priming urutan-spesifik dalam profil DNA. Sebaliknya, dalam pengurutan DNA, PCR bertanggung jawab atas penggabungan dideoksinukleotida berlabel ke amplikon.
Pentingnya
Profil DNA penting dalam identifikasi individu dalam studi forensik serta pengujian keturunan sementara sekuensing DNA penting untuk mempelajari genom dan proteom, identifikasi alel baru, dll.
Kata terakhir
Pada dasarnya, pembuatan profil DNA adalah teknik yang dapat diterapkan secara luas dalam studi forensik untuk identifikasi individu tergantung pada susunan genetik mereka. Umumnya, menggunakan pola STR dari lokus tertentu untuk tujuan tersebut. Di sisi lain, sekuensing DNA adalah teknik dalam biologi molekuler, mengungkapkan urutan nukleotida dari fragmen DNA tertentu. Pada dasarnya, penting untuk mempelajari genom, identifikasi alel baru, dll. Maka dari itu, Perbedaan yang menonjol antara pembuatan profil DNA dan pengurutan DNA adalah prosedur dan kepentingannya.
Sumber bacaan:
- Cornell, Brent. “Profil DNA.” BioNinja, Tersedia Di Sini . 2. Adams, J. (2008) teknologi sekuensing DNA. Nature Education 1(1):193, Tersedia Disini .
Sumber gambar:
- “Ahli kimia CBP membaca profil DNA” Oleh James Tourtellotte, editor foto CBP Today ( Domain Publik ) melalui Commons Wikimedia 2. “Tahap Gene Fingerprinting” Oleh Sneptunebear16 – Karya sendiri ( CC BY-SA 4.0 ) melalui Commons Wikimedia 3. “Radioactive Fluorescent Seq” Oleh Abizar di Wikipedia bahasa Inggris ( CC BY-SA 3.0 ) melalui Commons Wikimedia 4. “Pengurutan Sanger” Oleh Estevezj – Karya sendiri ( CC BY-SA 3.0 ) melalui Commons Wikimedia
