Perbedaan yang menonjol antara proteomik dan transkriptomik adalah proteomik adalah studi tentang seluruh rangkaian protein yang dihasilkan oleh organisme tertentu sedangkan transkriptomik adalah studi tentang seluruh rangkaian mRNA yang disintesis oleh organisme tertentu .
Proteomik dan transkriptomik adalah dua bidang di mana ekspresi gen organisme tertentu dipelajari.
Topik bahasan kami tentang:
- Apa itu Proteomik – Pengertian, Fakta, Aplikasi 2. Apa itu Transkriptomik – Pengertian, Fakta, Aplikasi 3. Apa Persamaan Antara Proteomik dan Transkriptomik – Garis Besar Karakteristik Umum 4. Apa Perbedaan Antara Proteomik dan Transkriptomik – Perbandingan Perbedaan Kunci
Istilah Utama
Aplikasi, mRNA, Protein, Proteomik, Teknik, Transkriptomik
Yang perlu anda ketahui tentang Proteomik?
Proteomik adalah studi skala besar tentang proteom. Proteom adalah istilah untuk seluruh rangkaian protein yang diproduksi oleh organisme atau sel tertentu. Maka dari itu, jenis organisme atau sel tertentu memiliki proteom yang unik. Bidang investigasi utama proteomik adalah sebagai berikut.
- prediksi struktur 3D protein;
- Deteksi lokasi dan waktu sintesis protein;
- Laju produksi protein, degradasi, dan kelimpahan kondisi mapan;
- Modifikasi protein seperti modifikasi pasca-translasi;
- Transpor protein antar kompartemen subseluler;
- Keterlibatan protein dalam jalur metabolisme;
- Interaksi protein satu sama lain.
Gambar 1: Contoh struktur protein yang tersedia dari PDB
Beberapa teknologi throughput tinggi seperti spektroskopi massa dan perbedaan dalam elektroforesis gel (DIGE) terlibat dalam studi proteomik.
Yang perlu anda ketahui tentang Transkriptomik?
Transkriptomik adalah studi tentang transkriptom organisme atau sel tertentu. Transkriptom adalah istilah untuk seluruh rangkaian mRNA dalam organisme atau sel. Namun, kadang-kadang juga adalah istilah untuk seluruh rangkaian RNA. Transkriptom bervariasi dengan kondisi lingkungan yang harus dihadapi organisme atau sel. Maka dari itu, ini mencerminkan set RNA yang diekspresikan pada waktu yang ditentukan di bawah serangkaian kondisi tertentu. Transcriptomik mencakup penyelidikan profil ekspresi dan analisis varian irisan. Microarray DNA dan RNA Seq adalah dua teknologi utama yang digunakan dalam transkriptomik.
Gambar 2: Microarray dan RNA Seq
Persamaan Antara Proteomik dan Transkriptomik
- Proteomik dan transkriptomik adalah dua jenis bidang yang mempelajari ekspresi gen organisme tertentu atau jenis sel.
- Teknik throughput tinggi digunakan dalam proteomik dan transkriptomik.
Perbedaan Antara Proteomik dan Transkriptomik
Definisi
Proteomik adalah istilah untuk studi tentang proteom dan fungsinya sedangkan transkriptomik adalah istilah untuk studi transkriptom dan fungsinya.
Jenis Studi
Proteomik mempelajari seluruh rangkaian protein yang diekspresikan sementara transkriptomik mempelajari seluruh rangkaian mRNA yang diekspresikan dalam organisme tertentu.
fenomena
Proteomik mempelajari struktur 3D dan fungsi protein, dan interaksi protein-protein sementara transkriptomik mempelajari struktur urutan, interaksi dengan lingkungan dan aplikasi mRNA.
Teknik
Proteomik melibatkan spektroskopi massa dan elektroforesis gel perbedaan (DIGE) sementara transkriptomik melibatkan microarray DNA dan RNA Seq sebagai teknik.
Area Penting
Beberapa area penting dari proteomik adalah pengembangan basis data proteom seperti SWISS-2DPAGE dan pengembangan perangkat lunak untuk desain obat berbantuan komputer sementara transkriptomik terlibat dalam studi diferensiasi seluler, karsinogenesis, mekanisme molekuler, dan jalur pensinyalan, yang mengontrol perkembangan embrio awal, seperti biomarker untuk penilaian risiko obat atau bahan kimia, dan menyimpulkan hubungan filogenetik antar individu.
Kata terakhir
Proteomik adalah studi tentang seluruh rangkaian protein organisme tertentu sedangkan transkriptomik adalah studi tentang seluruh rangkaian mRNA organisme. Maka dari itu, Perbedaan yang menonjol antara proteomik dan transkriptomik adalah jenis studinya.
Sumber bacaan:
- “Apa itu Proteomik?” Proteomik: Pengantar Sumber Daya EMBL-EBI, 8 Juni 2016, Tersedia Di Sini 2. Lowe, Rohan et al. “Teknologi Transkriptomik.” Biologi Komputasi PLoS 13.5 (2017): e1005457. PMC. Web. 10 Juli 2018, Tersedia Disini
Sumber gambar:
- “Contoh struktur protein” Oleh Axel Griewel – Karya sendiri ( CC BY-SA 3.0 ) melalui Commons Wikimedia 2. “Microarray dan sel aliran sekuensing” Oleh Thomas Shafee – Karya sendiri ( CC BY 4.0 ) melalui Commons Wikimedia
